Cromosoma 1
cromosoma umano
Con il nome di cromosoma 1 si indica, per convenzione, il più grande cromosoma umano. Le persone presentano solitamente due copie del cromosoma 1, come di ogni autosoma. Il cromosoma 1 possiede all'incirca 249 milioni di nucleotidi. I due cromosomi 1 rappresentano all'incirca l'8% del DNA totale nelle cellule umane.
| Cromosoma 1 | |
|---|---|
| Informazioni generali | |
| Lunghezza | 247.249.719 bps |
| SNPs | 923.864 |
| Geni che codificano per proteine | |
| Noti | 2.235 |
| Presunti | 79 |
| Pseudogeni | 51 |
| Geni che codificano per RNA | |
| rRNA | 42 |
| miRNA | 38 |
| snRNA | 178 |
| snoRNA | 70 |
| Altri RNA | 93 |
| Rappresentazione grafica | |
 | |
| Dati aggiornati su Ensembl | |
Il cromosoma 1 contiene di certo oltre 2600 geni[1], ma è ritenuto contenerne oltre 3000, un numero decisamente maggiore di quanto si fosse ipotizzato all'inizio del Progetto Genoma. Il cromosoma, in ogni caso, è stato completamente sequenziato dopo circa vent'anni dall'inizio del progetto stesso[2].
Il numero di polimorfismi a singolo nucleotide (SNP) è di oltre 900.000.
Geni sul cromosoma umano 1 modifica
La lista seguente contiene alcuni dei geni localizzati sul cromosoma 1.
- ACADM: acil-coenzima A deidrogenasi
- COL11A1: collagene, tipo XI, alfa 1
- CPT2: carnitina palmitoiltransferasi II
- DBT: diidrolipoamide transacilasi E2 (per catene ramificate)
- DIRAS3: GTP-binding RAS-like 3 (DIRAS family)
- ESPN: espina (sordità autosomica recessiva 36)
- F5: fattore di coagulazione V (proaccelerina)
- FMO3: monoossigenasi contenente flavina 3
- GALE: UDP-galattosio-4-epimerasi
- GBA: glucosidasi (gene della malattia di Gaucher)
- GJB3: proteina delle gap junction (connexina 31)
- GLC1A: gene responsabile del glaucoma
- HFE2: gene responsabile della emocromatosi di tipo 2 (giovanile)
- HMGCL: 3-idrossimetil-3-metilglutaril-coenzima A liasi
- HPC1: gene legato al cancro alla prostata
- IRF6: gene legato alla formazione del tessuto connettivo
- KCNQ4: canale voltaggio-dipendente del potassio (membro 4 della sottofamiglia KQT-like)
- KIF1B: membro 1B della famiglia delle kinesine
- LMNA: lamina A/C
- MFN2: mitofusina 2
- MPZ: proteina zero della mielina (legata alla neuropatia 1B di Charcot-Marie-Tooth)
- MTHFR: 5,10-metilenetetraidrofolato reduttasi (NADPH)
- MTR: 5-metiltetraidrofolato-omocisteina metiltransferasi
- MUTYH: omologo di mutY (E. coli)
- PARK7: gene responsabile della malattia di Parkinson 7 (forma autosomica recessiva, ad insorgenza precoce)
- PINK1: chinasi putativa indotta da PTEN
- PLOD1: procollageno-lisina 1, 2-ossoglutarate 5-diossigenasi 1
- PPOX: protoporfirinogeno ossidasi
- PSEN2: presenilina 2 (correlata alla malattia di Alzheimer di tipo 4)
- SDHB: subunità B del complesso della succinato deidrogenasi
- TSHB: ormone stimolante la tiroide TSH, forma β
- UROD: uroporfirinogeno decarbossilasi (correlato alla porfiria cutanea tarda)
- USH2A: correlato alla sindrome di Usher 2A (forma lieve, autosomica recessiva)
Malattie modifica
Le malattie seguenti sono alcune di quelle ritenute essere correlate a disordini genetici a carico del cromosoma 1 (il cromosoma che presenta il maggior numero di patologie genetiche conosciute, circa 890).
- cancro alla mammella;
- cancro alla prostata;
- malattie del collagene di tipo II e XI;
- deficienza di 3-idrossi-3-metilglutaril-CoA liasi;
- deficienza di carnitina palmitoiltransferasi II;
- emocromatosi di tipo 2;
- feocromocitoma;
- galattosemia;
- glaucoma;
- ipotiroidismo congenito;
- malattia di Alzheimer di tipo 4;
- malattia di Charcot-Marie-Tooth di tipo 1 e 2;
- malattia di Ehlers-Danlos;
- malattia di Gaucher di tipo 1, 2 e 3 (e malattie Gaucher-simili);
- malattia di Parkinson;
- omocisteinuria;
- poliposi adenomatosa famigliare (FAP);
- porfiria epatoeritropoietica e porfiria cutanea tarda;
- sordità autosomica recessiva (tipo 36);
- sordità non sintomatica autosomica dominante ed autosomica recessiva;
- trombofilia;
- sindrome di Stickler;
- sindrome di Usher di tipo II;
- sindrome di Van der Woude;
- Modifica di Sindrome di Urbach-Wiethe
- trimetilaminuria.
Note modifica
- ^ Non è possibile indicare un numero preciso di geni, dal momento che esistono diversi approcci per il calcolo di tale numero
- ^ (EN) Gregory SG et al The DNA sequence and biological annotation of human chromosome 1. Nature. 2006 May 18;441(7091):315-321 Archiviato il 26 marzo 2015 in Internet Archive.
Bibliografia modifica
- (EN) Murphy WJ, Fronicke L, O'Brien SJ, Stanyon R. The origin of human chromosome 1 and its homologs in placental mammals. Genome Res. 2003 Aug;13(8):1880-8. Epub 2003 Jul 17, su genome.org.
- (EN) National Institutes of Health, Chromosome 1, su Genetics Home Reference. URL consultato il 1º dicembre 2006 (archiviato dall'url originale il 4 febbraio 2012).
- (EN) Schutte BC, Carpten JD, Forus A, Gregory SG, Horii A, White PS, Report and abstracts of the sixth international workshop on human chromosome 1 mapping 2000. Iowa City, Iowa, USA. 30 settembre-3 ottobre 2000, in Cytogenet Cell Genet, vol. 92, n. 1-2, 2001, pp. 23-41, PMID 11306795.
- Reuters Wed May 17, 2006 [collegamento interrotto], su today.reuters.com.
Altri progetti modifica
Wikimedia Commons contiene immagini o altri file su cromosoma 1
Collegamenti esterni modifica
- Introduzione Archiviato il 4 febbraio 2012 in Internet Archive. degli NIH
- Mappa su Ensembl!
- Filogenesi su Ensembl!
