La Coppa Italia 2005-06 fu la 18ª edizione della Coppa Italia di rugby a 15. Per esigenze di sponsorizzazione fu nota come Škoda Cup 2005-06 grazie all'accordo commerciale siglato nel 2002 tra Lega Italiana Rugby d'Eccellenza, organizzatrice del torneo, e il marchio automobilistico Škoda.
Le dieci squadre furono ripartite in tre gironi in base al piazzamento di ciascuna di esse in classifica al termine del girone d'andata del campionato; un girone fu composto di 4 squadre e gli altri due da tre.
Ai fini della composizione degli accoppiamenti di semifinale, si qualificarono le prime due del girone da quattro e la prima di ogni girone da tre; ad ospitare la finale fu destinato per la terza volta consecutiva lo stadio stadio Armando Picchi di Jesolo.