Prima di unirsi alla Major League Baseball nel 1969 assieme ad altre tre squadre, i Padres erano una squadra della Minor League, precisamente aggregate alla Pacific Coast League (di cui ottennero il titolo nel 1937). Nella loro storia, i Padres hanno conquistato due volte il titolo della National League (1984 e 1998), ma non sono mai riusciti a vincere le World Series.
Il nome della squadra è un riferimento alla comunità di padri francescani (padres in lingua spagnola) che fondarono la città di San Diego nel 1769.
La squadra ha adottato il nome utilizzato dalla stessa disputando la Pacific Coast League, una lega delle Minor Leagues a cui i San Diego Padres parteciparono a partire dal 1936. Nel 1937 i Padres riuscirono anche a vincere il campionato della PCL grazie alle prestazioni di un giovanissimo Ted Williams, originario di San Diego e inserito nella Hall of Fame della MLB nel 1966.
Nel 1969, insieme ad altre tre squadre (i Montreal Expos, i Kansas City Royals e i Seattle Pilots), i San Diego Padres si unirono definitivamente alla MLB. Uno dei suoi primi proprietari fu C. Arnholt Smith, noto uomo d'affari della città di San Diego ed ex-presidente dei PCL Padres, con interessi anche nel settore bancario, immobiliare e nella pesca commerciale. Nonostante il clamore e l'entusiasmo dell'esordio nella MLB (con la costruzione anche di un nuovo stadio), tuttavia, la guida di esperti dirigenti come Eddie Leishman e Buzzie Bavasi non portò i risultati sperati: nelle prime sei stagioni in MLB, i Padres finirono sempre in ultima posizione nella NL West Division, perdendo più di 100 partite in quattro di queste sei stagioni. Una delle poche note positive di questo pessimo esordio iniziale per i Padres è stato il prima baseNate Colbert, preso dagli Houston Astros e che è ad oggi ancora il giocatore dei Padres ad aver messo a segno più fuori campo nella storia della squadra.
Negli anni seguenti, però, le fortune della squadra cominciarono a migliorare fino a riuscire a vincere la NL West Division per ben cinque volte e a raggiungere le World Series in due occasioni, nel 1984 e nel 1998, risultandone sconfitti in entrambe. L'uomo-simbolo dei Padres negli anni Ottanta e Novanta è stato certamente Tony Gwynn, esterno destro in grado di vincere nella sua carriera ben 8 riconoscimenti personali per le sue prestazioni in battuta. Nel 2004 i Padres si sono trasferiti nel loro attuale impianto, il PETCO Park.
Il 20 agosto 2020, i Padres sono riusciti nell'impresa di diventare la prima squadra di MLB a realizzare un grand slam in ben 4 partite consecutive (guadagnandosi in tal modo il soprannome di Slam Diego Padres).[2]
Fino alla stagione 2021, i Padres rimanevano l'unica squadra a non aver ancora lanciato un no-hitter. Questo record negativo è stato rotto finalmente il 9 aprile 2021, quando il lanciatore dei Padres Joe Musgrove è riuscito nell'impresa di non riuscire a far battere nemmeno una valida ai battitori dei Texas Rangers in tutto il corso della partita.[3] In precedenza, il lanciatore dei Padres ad essere arrivato più vicino al risultato poi conseguito da Musgrove era stato Andy Ashby, che il 5 settembre 1997 riuscì a portare il suo ruolino di marcia immacolato contro gli Atlanta Braves soltanto fino al 9° inning.[4]
Dal 1969 fino al 1993, i San Diego Padres hanno tenuto il loro spring training a Yuma (Arizona), giocando le proprie partite casalinghe presso il Desert Sun Stadium. La località di Yuma era stata scelta per la breve distanza che i tifosi dei Padres dovevano coprire da San Diego, essendo le due località collegate facilmente dalla Interstate 8.
A partire dal 1994, i Padres hanno trasferito il loro "quartier generale" per lo Spring Training presso il Peoria Sports Complex di Peoria (sempre in Arizona). Il trasferimento da Yuma a Peoria ha sollevato numerose polemiche per via della notevole distanza di Peoria da San Diego; tuttavia la squadra ha giustificato tale scelta con le pessime condizioni del centro sportivo di Yuma e con la distanza che quest'ultima località ha rispetto alla sede delle altre squadre (tutte concentrate nell'area compresa tra Phoenix e Tucson).
Stati Uniti
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