Piega di Rossmann

motivo strutturale proteico delle proteine che legano i nucleotidi

La piega di Rossmann è un dominio strutturale proteico delle proteine che legano i nucleotidi, specialmente il cofattore NAD.[1] La struttura con due ripetizioni è composta da sei filamenti β paralleli, collegati a due coppie di α eliche nell'ordine topologico β-α-β-α-β. Poiché ogni piega di Rossmann può legare un solo nucleotide, i legami dei domini per i dinucleotidi come il NAD consistono di due pieghe di Rossmann accoppiate che legano ciascuna una metà del nucleotide della molecola del cofattore. Le singole pieghe di Rossmann possono legare i mononucleotidi β come il cofattore FMN.

Un esempio di piega di Rossmann nella decarbossilasi del batterio Staphylococcus epidermidis (PDB ID 1G5Q) che mostra il cofattore vincolato della FMN.
Diagramma schematico di una piega di Rossmann a sei filamenti
Visione frontale
Visione laterale

Il motivo prende il nome da Michael Rossmann, che per primo mise in evidenza che questo è un motivo frequentemente ricorrente nelle proteine che si legano a nucleotidi, come la deidrogenasi.[2]

Nel 1989 Israel Hanukoglu dell'Istituto Weizmann scoprì che la sequenza consenso per il sito di legame dell'NADP in alcuni enzimi che utilizzano il NADP differisce dal motivo del legame del NAD.[3] Questa scoperta fu utilizzata per reingegnerizzare le specificità degli enzimi.[4]

NoteModifica

  1. ^ Hanukoglu I., Proteopedia: Rossmann fold: A beta-alpha-beta fold at dinucleotide binding sites, in Biochem Mol Biol Educ, vol. 43, n. 3, 2015, pp. 206-209, DOI:10.1002/bmb.20849, PMID 25704928.
  2. ^ Rao S., Rossmann M., Comparison of super-secondary structures in proteins, in J Mol Biol, vol. 76, n. 2, 1973, pp. 241-56, DOI:10.1016/0022-2836(73)90388-4, PMID 4737475.
  3. ^ Hanukoglu I., Gutfinger T., cDNA sequence of adrenodoxin reductase. Identification of NADP-binding sites in oxidoreductases., in Eur J Biochem, vol. 180, n. 2, Mar 1989, pp. 479-484, DOI:10.1111/j.1432-1033.1989.tb14671.x, PMID 2924777.
  4. ^ Scrutton N. S., Berry A., Perham R. N., Redesign of the coenzyme specificity of a dehydrogenase by protein engineering., in Nature, vol. 343, n. 6253, gennaio 1990, pp. 38-43, DOI:10.1038/343038a0, PMID 2296288.