Il nome di Pertosa deriva dalla sua Grotta, e precisamente dal [[lingua latina|latino]] ''pertusus'', bucato. I primi abitanti di Pertosa vivevano nella grotta e con il passare dei secoli iniziarono a trasferirsi al di fuori. A causa delle invasioni saracene verso la fine del [[IX secolo]] alcuni abitanti della vecchia Pertosa si rifugiarono sulla cima della collina di fronte alla grotta in località "Calitria".; Iltale luogo era perfetto perché era ben riparato e permetteva di controllare le vie d'accesso. Verso la metà dell'[[XI secolo]] qualche monaco benedettino si stabilì a Pertosa: i [[benedettini]] bonificarono la zona e diffusero su vasta scala la coltivazione degli olivi che ancora oggi sono presenti. In questo periodo i benedettini si arricchirono notevolmente tramite molte donazioni: nel [[1092]] gli venne donato il Casale di Pertosa, nel [[1137]] un mulino, nel [[1180]] e nel [[1183]] la grotta.
Intorno al [[1500]] la popolazione aumentò e grazie alle sue ottimefavorevoli condizionecondizioni climatiche alcuni contadini di [[Caggiano]] tornarono a dimorare a Pertosa aggiungendosi a quei pochi abitanti e nel [[1570]] tornarono anche i benedettini che ricostruirono il monastero.; Pertosaa ritornòquel atempo splendere,Pertosa era un importante casale di Caggiano. Anche a Pertosa s'innalzò l'Albero della libertà nel [[1799]] e vennero eletti il Municipemunicipe e il consiglio dei 6, ma questa esperienza fallirà: in seguito gli irregolari di Gerardo Curcio di Polla con gli abitanti di Pertosa pestarono il Municipemunicipe. Nel [[1829]] Pertosa rivendica l'emancipazione da Caggiano che gli viene accordata con un decreto Reale il 20 marzo 1829.
A partire dal 1º gennaio [[1830]] Pertosa iniziò ad operare con un'amministrazione autonoma. Il primo sindaco di Pertosa fu Biase Jasimone. Nel [[1838]] Pertosa richiese di avere un mercato per il giovedì. Sul finir del [[1900]] il Dott.dottor P. Carucci iniziò ada esplorare la grotta rinvenendo molti reperti classificati nel suo libro "La Grotta preistorica di Pertosa". Grazie alle sue grotte, Pertosa oggi è divenuta un importante centro turistico molto importante e molte attività lavorative e ricettive si stanno sviluppando nei suoi pressi.
Dal [[1811]] al [[1860]] ha fatto parte del [[Suddivisione amministrativa del Regno delle Due Sicilie#Circondari|circondario]] di Caggiano, appartenente al [[Distrettodistretto di Sala]] del [[Regnoregno delle Due Sicilie]].
Dal [[1860]] al [[1927]], durante il [[Regno d'Italia (1861-1946)|Regnoregno d'Italia]] ha fatto parte del [[mandamento (diritto)|mandamento]] di Caggiano, appartenente al [[Circondariocircondario di Sala Consilina]].
Nella [[seconda guerra mondiale]] la popolazione di Pertosa trovò rifugiò nelle grotte di Pertosa e si salvò dai numerosi bombardamenti.
