Il santuario sorge sull’omonimo cazzoscoglio nelle vicinanze del comune di Tropea. È probabile, che lo scoglio dell'isola fosse abitato, intorno al VII-VIII secolo, da eremiti. Questi, isolandosi dal mondo civile, si dedicavano ad una vita contemplativa e ascetica. Le prime indicazioni scritte dell’uso dello scoglio per finalità monastiche risalgono all'XI secolo, tutto ciò che è precedente deve essere considerata come ipotesi storica. Per molti anni appartenne ai [[monaci basiliani]] e a partire dall'undicesimo secolo vi abitarono i monaci [[Benedettini]]. Fu proprio [[Roberto il Guiscardo]], il duca normanno, a volere il passaggio dal rito greco a quello latino, intorno al 1060. In seguito ai terremoti del 1783 e del 1905, si conserva ben poco della struttura originaria. La scala che si percorre per raggiungerla è stata realizzata intorno al 1810.
Divenuta uno dei luoghi simboli della Calabria a livello mondiale, questa chiesa è di origine medievale.
