Il volo GA200 era decollato da Jakarta alle 16:00 locali ([[UTC]] +7) e trasportava 133 passeggeri, di cui 19 stranieri (10 australiani, 2 americani, 5 tedeschi e 2 coreani). <ref>{{cita web|url=https://web.archive.org/web/20070930222317/http://www.swissinfo.org/eng/international/ticker/detail/Indonesia_crash_survivors_describe_ordeal.html?siteSect=143&sid=7595071&cKey=1173253988000|titolo=Indonesia crash survivors describe ordeal
|accesso=29 novembre 2019|lingua=en|sito=|data=7 marzo 2007}}</ref>
Alle 16:55 i piloti hanno ricevuto l'autorizzazione dal [[controllo del traffico aereo|controllore di volo]] ad effettuare un avvicinamento a vista; alle 16:58:10 l'aereo ha oltrepassato la soglia della pista 09 ad una velocità di 87 [[Nodo (unità di misura)|nodi]] superiore a quella consentita, ha toccato terra una prima volta ed ha rimbalzato altre due volte, prima di terminare la sua corsa 160 metri oltre la fine della pista in un campo, dove si è spezzato in più parti ed ha preso fuoco.
Alle 18:58 ora locale 2 il capitano ha tentato di atterrare all'aeroporto internazionale Adisutjipto di Yogyakarta, nonostante un approccio difettoso con velocità eccessiva e discesa ripida, e i conseguenti avvisi di copilota e sistema di volo. [12] L'aereo è atterrato a 860 m oltre la soglia della pista [2]: 48 a una velocità di 221 nodi (409 km / h; 254 mph), 87 nodi (161 km / h; 100 mph) più veloce della normale velocità di atterraggio. [2 ]: 51 Secondo i passeggeri, l'aereo ha tremato violentemente prima di schiantarsi. [13] L'aeromobile sorvolò la fine della pista, attraversò la recinzione perimetrale, fu gravemente danneggiato quando attraversò una strada e si fermò in un vicino campo di riso. Si scatenò un incendio alimentato a carburante, che non poteva essere raggiunto dai veicoli antincendio aeroportuali. Mentre la maggior parte dei passeggeri era in grado di fuggire, un certo numero di passeggeri morì all'interno della fusoliera in fiamme. [14]
Il pilota, il capitano Muhammad Marwoto Komar, inizialmente affermò che ci fu un improvviso sdoganamento immediatamente prima dell'atterraggio del volo e che i flap sull'aereo potrebbero non funzionare correttamente. [15]
