Motivo adiacente al Protospacer: differenze tra le versioni

Ad esempio il sistema CRISPR/C2c2 del batterio Leptotrichia shahii è CRISPR guidato da RNA che etichetta altro RNA piuttosto che DNA. Le PAM non sono fondamentali per un CRISPR che riconosce RNA; tuttavia l'efficacia del suo clivaggio è modulata da un omologo funzionale: una [[Guanina|guaninguanina]]<nowiki/>a che costeggia la sequenza da clivare, denominata in questo caso PFS (Protospacer Flanking Site).<ref name="pmid27256883">{{Cita pubblicazione|doi=10.1126/science.aaf5573|PMID=27256883}}</ref>