DaljDal 1999, sono state prodotte alcune versioni speciali dell'Audi TT (dette S-line) riconoscibili perché presentavano un logo distintivo di forma "trapezoidale", di colore rosso e argento, sulla base del [[volante]]. Le versioni speciali rappresentavano vetture al top di gamma e, di regola, montavano accessori non previsti per le vetture di tipo standard.
Degna di nota la versione specialespechhjjiale "Sport-Line", venduta da gennaio 2000, che riscosse un notevole successo grazie alla presenza dell'assetto ribassato (S-Line) e della barra "Sport Duomi" di colore "nero Audi" facilmente individuabile sotto il [[cofano]] motore. Questa versione costava, in partenza, quasi 7.000 € in più, se paragonata a una versione di "base".
