SMILES: differenze tra le versioni

Gli atomi sono rappresentati utilizzando il loro simbolo chimico chiuso tra parentesi quadre, come [Au] per [[oro]]. L'[[anione]] [[idrossido]] è [OH-]. Le parentesi quadre possono essere omesse per gli atomi "organici" [[carbonio|C]], [[azoto|N]], [[ossigeno|O]], [[fosforo|P]], [[zolfo|S]], [[bromo|Br]], [[cloro|Cl]] e [[iodio|I]]. Tutti gli altri elementi devono essere racchiusi tra parentesi quadre. Se si omettono le parentesi quadre, si presume che il numero degli atomi di idrogeno sia implicito; per esempio lo SMILES per l'[[acqua]] è semplicemente O e per l'[[etanolo]] è CCO.

 

 

Il [[cicloesano]] è rappresentato come C1CCCCC1, l'idea è che i due uno indicano la stessa posizione nella molecola, formando così un anello con sei atomi di carbonio. Da notare che è il numerale (in questo caso 1) che rappresenta la posizione piuttosto che la combinazione "C1". Ecco la notazione espansa per chiarire: (C1)-(C)-(C)-(C)-(C)-(C)-1 piuttosto che (C1)-(C)-(C)-(C)-(C)-(C)-(C1).