Appassionato zoologo, Hodgson studiò estensivamente la [[fauna]] delle regioni del Nepal, del [[Sikkim]] e del [[Bengala]]. Nel corso degli anni, mise insiemeassieme una grande collezione di uccelli e pelli di mammiferi che successivamente donò al [[British Museum]]. Tra i suoi contributi alla zoologia, vi è la scoperta di una nuova specie di [[antilope]], l'[[antilope tibetana]], che in suo onore vennefu chiamata ''Pantholops hodgsonii''. Scoprì anche 39 specie di mammiferi e 124 specie di uccelli, 79 delle quali furono descritte da lui stesso.
Le collezioni zoologiche presentate da Hodgson al British Museum nel [[1843]] e nel [[1858]] al British Museum comprendevano 10.499 esemplari. Le due collezioni includevano anche un gran numero di disegni e schizzi colorati di animali indiani, eseguiti sotto la sua supervisione dagli artisti del posto, la maggior parte dei quali fuvenne trasferita in seguito alla [[Zoological Society of London]].