UniProt: differenze tra le versioni

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|commerciale = no
|tipo = [[Database]]
|lingua = EN
|proprietario = UniProt Consortium
|autore = [[European Bioinformatics Institute|EMBL-EBI]], UK; [[Swiss Institute of Bioinformatics|SIB]], Switzerland; [[Protein Information Resource|PIR]], US.
|data di lancio = dicembre 2003
|stato corrente = Attivo
|screenshot =
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==Le origini dei database UniProt==
Ogni membro del consorzio è fortemente impegnato nella gestione del database di proteine e nellanelle sua implementazioneannotazioni. Fino a poco tempo fa, EBI e SIB insieme producevano i database Swiss-Prot e TrEMBL, mentre PIR produceva il suo database delle [[Sequenza peptidica|sequenze proteiche]] (Protein Sequence, PIR-PSD).<ref name="pmid12230036">{{cite journal |author=O'Donovan C, Martin MJ, Gattiker A, Gasteiger E, Bairoch A, Apweiler R |title=High-quality protein knowledge resource: SWISS-PROT and TrEMBL |journal=Brief. Bioinformatics |volume=3 |issue=3 |pages=275–84 |year=2002 |month=settembre |pmid=12230036 |doi= |url=}}</ref><ref name="pmid12520019">{{cite journal |author=Wu CH, Yeh LS, Huang H, ''et al.'' |title=The Protein Information Resource |journal=Nucleic Acids Res. |volume=31 |issue=1 |pages=345–7 |year=2003 |month=gennaio |pmid=12520019 |pmc=165487 |doi= |url=}}</ref><ref name="pmid12520024">{{cite journal |author=Boeckmann B, Bairoch A, Apweiler R, ''et al.'' |title=The SWISS-PROT protein knowledgebase and its supplement TrEMBL in 2003 |journal=Nucleic Acids Res. |volume=31 |issue=1 |pages=365–70 |year=2003 |month=gennaio |pmid=12520024 |pmc=165542 |doi= |url=}}</ref> Questi database coesistevano con priorità diverse di copertura e annotazioni delle [[Sequenza peptidica|sequenze proteiche]].
 
Swiss-Prot è stata creata nel 1986 da [[Amos Bairoch]] durante il suo dottorato e sviluppata dal [[Swiss Institute of Bioinformatics]] e dall'[[European Bioinformatics Institute]].<ref name=Bairoch2000>{{cite journal |author=Bairoch Amos|title=[http://bioinformatics.oupjournals.org/cgi/reprint/16/1/48 Serendipity in bioinformatics, the tribulations of a Swiss bioinformatician through exciting times!] |journal=Bioinformatics |volume=16 |pages=48–64 |year=2000 |pmid=10812477 |doi=10.1093/bioinformatics/16.1.48 |issue=1}}</ref><ref>Séverine Altairac, "[http://expasy.org/prolune/pdf/prolune018_fr.pdf Naissance d’une banque de données: Interview du prof. Amos Bairoch]". ''[http://expasy.org/prolune/ Protéines à la Une]'', agosto 2006. ISSN 1660-9824.</ref> Swiss-Prot ha lo scopo di fornire sequenze proteiche affidabili associate a un elevato livello di annotazioni (come la descrizione della funzione di una proteina, la struttura del suo [[Dominio (biochimica)|dominio]], le [[Modificazione post traduzionale|modificazioni post traduzionali]], le varianti, etc.), un livello minimo di ridondanza e un alto livello di integrazione con altre banche dati. Riconoscendo che i dati della sequenza venivano prodotte ad un ritmo superiore alla capacità di gestirli di Swiss-Prot, venne creata TrEMBL (Translated EMBL Nucleotide Sequence Data Library) per fornire annotazioni automatizzate per le proteine ​​non ancora presenti in Swiss-Prot. Nel frattempo, PIR mantenne il PIR-PSD e i relativi database, compreso iProClass, un database di sequenze proteiche e famiglie.
 
I membri del consorzio hanno unito le loro risorse e competenze che si sovrapponevano, e lanciato UniProt nel dicembre 2003.<ref name="pmid15036160" />