Tre sono gli ambienti che si possono ritrovare all'interno del parco: zone umide, ambienti boscosi e ambienti palustri.
Il territorio del parco presenta una serie di zone umide di grande importanza tra cui le più famose sono il canneto dell'isola della Torre e l'isolone del Serraglio, che insieme cavolo costituiscono una zona acquitrinosa sita presso [[Brivio]] e vasta 2,65 km<sup>2</sup>. Queste zone umide sono i resti del vasto manto boscoso che fino al secolo scorso ricoprivano la [[Pianura Padana]] e che, a causa dell'attività umana di disboscamento, sono scomparse. Il manto boscoso dove si trovano le specie arboree dal fusto alto come [[Alnus glutinosa|ontani neri]], [[Platanus|platani]], [[Betula|betulle]], [[Populus|pioppi]], [[Salix|salici]] e [[Quercus|querce]] è dominato da ceduo. Nelle aree paludose si trovano fiori d'acqua: la [[Nymphaea|ninfea]], il [[Lilium|giglio selvatico giallo]], il [[Convallaria majalis|mughetto]] e fiori delle famiglie di veronica a spiga.