L'epcidina venne scoperta più o meno contemporaneamente da due gruppi indipendenti di ricercatori, mentre studiavano le proprietà antimicrobiche di alcuni peptidi. Inizialmente venne chiamata LEAP-1 Liver-Expressed Antimicrobial Protein (Proteina Antibatterica Espressa dal Fegato).<ref name="pmid11034317">{{Cita pubblicazione | autore = Krause A, Neitz S, Mägert HJ, Schulz A, Forssmann WG, Schulz-Knappe P, Adermann K | titolo = LEAP-1, a novel highly disulfide-bonded human peptide, exhibits antimicrobial activity | rivista = FEBS Lett. | volume = 480 | numero = 2-3 | pagine = 147–50 | anno = 2000 | mese=settembre| id = PMID 11034317 | doi = 10.1016/S0014-5793(00)01920-7 | url = | issn = }}</ref>, e successivamente epcidina (dall'inglese "Hep-" per fegato e "-cidin" per [[battericida]]).<ref name="pmid11113131">{{Cita pubblicazione | autore = Park CH, Valore EV, Waring AJ, Ganz T | titolo = Hepcidin, a urinary antimicrobial peptide synthesized in the liver | rivista = J. Biol. Chem. | volume = 276 | numero = 11 | pagine = 7806–10 | anno = 2001 | mese=marzo| id = PMID = 11113131 | doi = 10.1074/jbc.M008922200 | url = | issn = }}</ref>
Subito dopo la sua scoperta venne alla luce il suo ruolo nell'[[omeostasi]] del ferro: nel topo la sua produzione aumentava con il "carico" di ferro, così come durante l'infiammazione.
