Terminatore (biologia): differenze tra le versioni

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Nei [[procarioti]] esistono due tipi di terminatori:
 
* terminatore intrinseco o rho-indipendente: in questo sito l'oleoenzima è in grado di terminare la trascrizione senza l'intervento di fattori esterni. La terminazione è causata dalla formazione di strutture secondarie intramolecolari nell'RNA nascente. Tali strutture, dette strutture a forcina, si formano per adesione di regioni complementari ed impediscono all'RNA polimerasi di procedere oltre. La struttura a forcina, chiamata anche stem-loop, caratterizzata da una lunghezza di 7-20 coppie di basi, presenta uno stelo (la regione in cui i due filamenti si appaiano per effetto della complementarietàcomplementarità) ricco in coppie [[guanina]]-[[citosina]] molto stabili. Lo stelo è poi seguito da una serie (circa 6) di residui di [[uracile]], che si appaiono debolmente alle adenine del DNA stampo.
Una proteina legata a RNA polimerasi (nusA) si lega saldamente alla struttura stem-loop, in modo da causare l’arresto temporaneo dell’enzima stesso. Tale pausa coincide con la trascrizione della sequenza di poli-uracile. I legami deboli adenina-uracile destabilizzano il duplex RNA-DNA, generando il rilassamento e la dissociazione dalla RNA polimerasi.
Le strutture stem-loop seguite da una sequenza di poli-uracile, possono causare l’arresto della RNA polimerasi; in genere però possono continuare la trascrizione data la stabilità del duplex.