Il dipartimento del Benaco fu creato il [[3 novembre]] [[1797]]<ref>Legge 13 brumale anno VI a</ref> in seguito all'annessione alla [[Repubblica Cisalpina]] dei territori della Lombardia orientale, già appartenuti alla [[Repubblica di Venezia]] (per alcuni mesi, il territorio di Desenzano era stato parte dell'effimera [[Repubblica bresciana]]).
Il [[1º settembre]] [[1798]], con la nuova suddivisione della Repubblica Cisalpina in dipartimenti<ref>Legge 15 fruttidoro anno VI a</ref>, il Dipartimento del Benaco fu soppresso e il suo territorio assegnato al [[Dipartimento del Mella]], con [[capoluogo]] [[Brescia]].