La molecola viene utilizzata per via orale principalmente in campo otorinolaringoiatrico e stomatologico e nel trattamento di infezioni broncopolmonari, genito-urinarie (soprattutto a carico della [[prostata]]) o che interessano la [[cute]], le [[Osso|ossa]] e le [[articolazioni]].
Per via topica è usata soprattutto nella cura delle infezioni stafilococciche ([[foruncolosi]], [[impetigine]], [[sicosi]], [[pustole]] superficiali) e nella prevenzione delle infezioni in chirurgia e traumatologia.<br>
L'antibiotico in Europa è stato utilizzato ancheper più di 20 anni in agricoltura e zootecnia come additivo nella preparazione di alimenti per animali,. Il suo uso per questi scopi è stato oggi vietato in tutta l'[[Unione Europea]] in maquanto si ritiene vi siano ormai sufficienti fondamenti scientifici relativi all'esistenza di un nesso tra l'impiego della virginiamicina per questi usi e lo sviluppo nell'uomo della resistenza alle streptogramine, in particolare si pensa che la gran parte dei ceppi circolanti di Enterococcus faecium resistenti (SREF) derivi da questi usi.<ref name="pmid15028017">{{Cita pubblicazione | cognome = Cox | nome = LA. | coautori = DA. Popken | titolo = Quantifying human health risks from virginiamycin used in chickens. | rivista = Risk Anal | volume = 24 | numero = 1 | pagine = 271-88 | mese = Feb | anno = 2004 | doi = 10.1111/j.0272-4332.2004.00428.x | id = PMID 15028017 }}</ref><ref name="pmid12679267">{{Cita pubblicazione | cognome = Smith | nome = DL. | coautori = JA. Johnson; AD. Harris; JP. Furuno; EN. Perencevich; JG. Morris | titolo = Assessing risks for a pre-emergent pathogen: virginiamycin use and the emergence of streptogramin resistance in Enterococcus faecium. | rivista = Lancet Infect Dis | volume = 3 | numero = 4 | pagine = 241-9 | mese = Apr | anno = 2003 | doi = | id = PMID 12679267 }}</ref><ref name="pmid15574480">{{Cita pubblicazione | cognome = Hayes | nome = JR. | coautori = DD. Wagner; LL. English; LE. Carr; SW. Joseph | titolo = Distribution of streptogramin resistance determinants among Enterococcus faecium from a poultry production environment of the USA. | rivista = J Antimicrob Chemother | volume = 55 | numero = 1 | pagine = 123-6 | mese = Gen | anno = 2005 | doi = 10.1093/jac/dkh491 | id = PMID 15574480 }}</ref>
