Nell'ottobre [[2009]] Oettinger è stato indicato dal governo federale tedesco come commissario europeo per la [[Germania]] nella [[Commissione Barroso II]]. È entrato in carica il 10 febbraio 2010 come [[commissario europeo per l'energia]].
Nel settembre 2011 alcunehanno suscitato polemiche le sue dichiarazioni secondo cui le bandiere degli stati membri dell'[[Unione europea]] con un eccessivo deficit di Oettingerbilancio hannopubblico suscitatodovrebbero polemicheessere esposte a mezz'asta, spingendoe in precedenza aveva ipotizzato un commissariamento formale della [[Grecia]], per cui dei funzionari stranieri avrebbero dovuto prendere il posto del personale greco. 151 membri del [[Parlamento europeo]] ahanno chiederechiesto una rettifica oppure le sue dimissioni nelda commissario.<ref name="Grecia">{{cita web|url=http://euobserver.com/9/113619|titolo=MEPs call for German commissioner to apologise or resign|autore=Honor Mahony|editore=EU Observer|lingua=EN|data=14 settembre 2011|accesso=14 settembre 2011}}</ref>. Oettinger ha dichiarato che le bandiere degli stati membri dell'[[Unione europea]] con un eccessivo deficit di bilancio pubblico dovrebbero essere esposte a mezz'asta, e in precedenza aveva ipotizzato un commissariamento formale della [[Grecia]], per cui dei funzionari stranieri avrebbero dovuto prendere il posto del personale greco<ref name="Grecia"/>.
