Sequenza di Shine-Dalgarno: differenze tra le versioni

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In [[biologia molecolare]] si definisce '''sequenza di Shine-Dalgarno''' la sequenza di [[basi azotate]] presso cui il complesso [[ribosoma]]le dei [[bacteria|batteri]] è in grado di ancorarsi al filamento di [[mRNA]] maturo da [[sintesi proteica|tradurre]] in [[proteina]]. Tale sequenza permette al ribosoma di posizionarsi correttamente e di iniziare la traduzione con il corretto ''[[frame]]'' di lettura.
{{A|totalmente incomprensibile ai profani. Bisogna almeno contestualizzare la voce|biologia|aprile 2007|firma=[[Utente:Cotton|Cotton]] <sup>[[Discussioni utente:Cotton|<span style="color:#708090;">Segnali di fumo</span>]]</sup> 18:43, 5 apr 2007 (CEST)}}
 
Nel [[1975]] i ricercatori [[australia]]ni [[John Shine]] e [[Lynn Dalgarno]] hanno individuato la composizione di tale sequenza (AAGAAG) ed il suo posizionamento immediatamente a monte del [[codone]] di inizio (AUG) della traduzione<ref>{{en}} Shine J, Dalgarno L (1975). "Determinant of cistron specificity in bacterial ribosomes". Nature 254 (5495): 34-8 {{entrez Pubmed|803646}}</ref>.
La '''sequenza di Shine-Dalgarno''' (AGGAGG), proposta dagli scienzati Australiani [[John Shine]] e [[Lynn Dalgarno]], è un sito di ancoraggio per il complesso ribosomiale posto nella 5'UTR, cioè nella sequenza che precede il codone di inizio della traduzione proteica(AUG), sull'[[RNA messaggero]] maturo.
Questa sequenza consenso che aiuta a "reclutare" il complesso ribosomiale e a posizionarlo secondo il corretto quadro di lettura per il codone di inizio (AUG) è tipica dei [[procarioti]].
La sequenza complementare (UCCUCC), è chiamata ''sequenza anti-Shine Dalgarno'' ed è posta all'estremità 3' della subunità 16S del ribosoma.
 
La sequenza complementare (UCCUCC), è chiamata ''sequenza anti-Shine-Dalgarno'' ed è posta all'estremità 3' della subunità 16S del ribosoma. In questo modo viene dunque facilitato l'assemblaggio del complesso ribosomale stesso e l'avvio della traduzion. Quando le 2 sequenze sono appaiate, infatti, vengono reclutati anche i fattori di inizio IF2-GTP, IF1, IF3 (nonchè il fMet-tRNA).
Mutazioni nella sequenza di Shine-Dalgarno possono ridurre la traduzione proteica.
Questa riduzione è collegata ad una minore efficienza nell'appaiamento tra l'mRNA ed il ribosoma, come è stato evidenziato dal fatto che mutazioni sulla sequenza anti Shine-Dalgarno possono riportare la traduzione all'efficienza consueta.
 
Quando le 2 sequenze sono appaiate vengono reclutati i fattori di inizio IF2-GTP, IF1, IF3 così come il fMet-tRNA (fMET).
 
==Mutazioni==
Mutazioni nella sequenza di Shine-Dalgarno possono ridurre la traduzione proteica. Questa riduzione è collegata ad una minore efficienza nell'appaiamento tra l'mRNA ed il ribosoma, come è stato evidenziato dal fatto che mutazioni sulla sequenza anti Shine-Dalgarno possono riportare la traduzione all'efficienza consueta<ref>{{en}} [http://www.ncbi.nlm.nih.gov/books/bv.fcgi?rid=eurekah.section.19320 Structural Changes Associated with mRNA Binding and Initiation Events]</ref>.
 
== Bibliografia ==
<references/>
 
Shine J, Dalgarno L (1975). "Determinant of cistron specificity in bacterial ribosomes". Nature 254 (5495): 34-8
 
[[de:Shine-Dalgarno-Sequenz]]
[[en:Shine-Dalgarno sequence]]
[[ja:シャイン・ダルガノ配列]]
Voet D and Voet J. 2004 Biochemistry. 3rd Edition. John Wiley and Sons Inc: pp.1321-2 and pp.1342-3
 
 
== Collegamenti esterni ==
 
* http://www.ncbi.nlm.nih.gov/books/bv.fcgi?rid=eurekah.section.19320
 
[[[[Categoria:Biologia Genetica]]molecolare]]