Ritrovamenti di frammenti di ceramica e utensili di ossidiana suggeriscono che Basiluzzo fosse frequentata sin dall'etàdal neo-eneoliticatardo [[Età del rame|eneolitico]] e forse abitata stabilmente nell'[[età del Bronzo]].<ref>Medaglia, pagg. 172-173.</ref> Sono inoltre assai evidenti sull'isola i resti di una villa romana databile tra gli ultimi decenni del I sec. a.C. e la prima metà del I sec. d.C., probabilmente usata come residenza stagionale. eEsiste diinoltre una peschiera risalente allo stesso periodo, situata nei pressi dell'unico approdo dell'isola e sommersa a causa dei moti di bradisismo.<ref name=intro /><ref>Racheli, ediz. 1986, pag. 55.</ref> Fino agli inizi del [[XX secolo]] Basiluzzo è stata utilizzata come terreno di pascolo e di coltivazione, in particolare di capperi (''[[capparis spinosa]]''), tanto che nel [[1784]] nacque una controversia tra il [[Diocesi di Lipari|vescovo di Lipari]], che amministrava l'isola, ed alcuni contadini abusivi.<ref>Lo Cascio, pag. 27.</ref> Infine nel [[1991]] Basiluzzo, insieme agli altri isolotti minori di Panarea, è stata dichiarata [[Riserva naturale integrale]], con divieto di sbarco se non per scopi scientifici.<ref>Lo Cascio, pag. 208.</ref>
[[File:Basiluzzo.jpg|thumb|Basiluzzo con a sinistra Spinazzola e a destra [[Isola di Dattilo|Dattilo]]. Sullo sfondo, Stromboli.]]
