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*Scritto da: ''[[Andi Bushell]] & [[J.R. Orci]]''
===Trama===
Tutta la squadra in una chiesa partecipa al funerale di Nadia, mentre in un laboratorio, stanno facendo l'autopsia sul corpo di Renèe uccisa da Anna Espinosa. Durante l'autopsia estraggono dal corpo di Renèe un microchip. Sydney triste non si dà pace per essersi fidata ancora di Sloane. Intanto Kelly Peyton parla con Sloane riguardo al codice nascosto nella pagina 47. All'APO stanno cercando di capire cosa ci sia in quel chip, Marshall non riesce a decifrarlo. Per quanto sia in codice di trent'anni prima, non è decifrabile perché quel chip contiene solo la metà dei dati, ma qualcosa riesce a scoprire, sul chip è scritto "Andre Michaux" alias Vaughn. Purtroppo l'APO è sotto controllo da "Quinto Profeta" e quindi vengono immediatamente avvisati della scoperta fatta. Sydney cerca di far dormire la bimba, arriva Jack, e dice a Sydney che sul chip Marshall ha scoperto il nome impresso; Quindi si presuppone che i genitori di Renèe e di Vaughn trent'anni prima tentando di combattere "Quinto Profeta", abbiano impiantato i chip nel petto dei rispettivi figli. Ora bisogna contattare Vaughn che è nascosto in Nepal portargli il chip e tentare di capire di cosa si tratta, Sydney si offre per questa missione tentando di non comprometterlo. Purtroppo "Quinto Profeta" viene informato del viaggio in Nepal di Sydney, e intende mandare Anna Espinosa che ora ha le sembianze di Sydney per intercettare quel chip. Intanto all'APO Tom sta decifrando un messaggio in codice da una rivista, quando arriva Rachel e gli confessa la sua sofferenza nel sentirsi tradita prima da Dean e ora da Sloane e nel vedere morire i suoi colleghi, Tom tenta di rinfrancarla. Appena Rachel si allontana, Tom fa pubblicare un annuncio sulla rivista per rispondere al messaggio che ha ricevuto. Sloane parla con Anna istruendola su come muoversi quando incontrerà Vaughn, appena Anna se ne va, Sloane ha una visione; Nadia! In Nepal arriva Anna Espinosa che subito trova il contatto di Sydney, lo mette fuori gioco e manda un suo complice ad accogliere Sydney anche se non sa ancora bene cosa la aspetti. Marshall intanto all'APO scopre che le loro comunicazioni sono sotto controllo tramite una manomissione di Sloane, e avvisa Jack che informa subito Sydney. Sydney così scopre che si tratta di una trappola, ma l'auto dove viaggia si ribalta durante la colluttazione con il falso contatto. Arriva Anna che dadà fuoco alla macchina e poi va ad incontrare Vaughn. Appena Anna entra nella capanna incontra Vaughn, i due si abbracciano e subito Vaughn chiede di Isabelle, la figlia. Sydney fortunatamente si salva. Sloane dice a Kelly Peyton che per decifrare la Pagina 47 gli serve un libro che si trova a Ginevra; appena rimane solo ha nuovamente la visione di Nadia e parla con lei. Intanto Vaughn e Anna in Nepal parlano del chip, della morte Renèe e del fatto che proprio grazie a lei è Vaughn è riuscito a sapere di suo padre e di "Quinto Profeta". Chiede proprio ad Anna chi abbia ucciso Renèe, la quale risponde che è stata Anna Espinosa. Parlando del chip Vaughn scopre di avere proprio lui la parte mancante innestata nel petto e Anna lo estrae; le due parti combaciano alla perfezione! Nel frattempo Sydney, quella vera, è riuscita a trovare un mezzo per andare da Vaughn e ha avvisato Jack di quanto è accaduto. Kelly intanto recupera il manoscritto che desiderava Sloane, ma anche in questo caso accade qualcosa di strano, il libraio chiama al telefono qualcuno e lo avverte che stanno cercando di contattarlo, dicendo "non è lui anche se conosce il protocollo". Vaughn e Anna iniziano a verificare tra i dati del chip e vi trovano una mappa riconducibile alla guerra fredda, tipo un piano di evacuazione, un bunker antiatomico che si trova ad Amburgo. Così Vaughn e Anna partono per Amburgo e trovano il bunker sotto ad una gioielleria, mentre Sydney arriva in ritardo e non fa in tempo ad avvertire Vaughn del pericolo prima che parta. Jack informa la squadra APO che Vaughn è vivo e di quello che è accaduto a Sydney. Jack ha rintracciato Vaughn ad Amburgo assieme a Sydney ed ha accertato di conseguenza che la donna assieme a lui non era Sydney. Sloane con "il fantasma" di Nadia a fianco ritira il Libro e confessa a Kelly di essere turbato dagli ultimi eventi, dice che prima di andare avanti deve fare pace con il passato. Mentre Vaughn è nel bunker Anna informa della sua posizione, chiede il recupero e tenta di neutralizzare Vaughn, ma fortunatamente lui aveva già smascherato Anna e riesce a difendersi anche se solo l'arrivo tempestivo della vera Sydney lo salva. Finalmente Vaughn riesce a riabbracciare la sua Sydney. Sloane intanto in una chiesa accende una candela e appena si allontana arriva Sark che trova un bigliettino a lui destinato. Mentre Vaughn e Sydney insieme cercano di capire cosa si nasconda in quel bunker squilla il telefono di Anna e Sydney risponde; è kelly, pronta per il recupero di Anna. Sydney rapidamente informa Vaughn di Kelly Peyton, di Sloane alleato a "Quinto Profeta" e della morte di Nadia, poi va al punto di recupero al posto di Anna. Prima di andarsene lo avvisa anche di non tornare all'APO dato il pericolo di talpe al suo interno. Sydney dice a Vaughn di contattare Jack, lui accetta, e le dà la metà del chip per Kelly. Sydney sale in macchina, consegna il chip a Kelly e la macchina si allontana.
==Senza rancore==
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