Nel [[Superstock 1000 FIM Cup 2016|2016]] Rinaldi passa alla [[Superstock 1000 FIM Cup]], dove corre in sella ad una [[Ducati Panigale|Ducati Panigale R]] del team [[Ducati Corse|Aruba.it Racing – Junior]]. Il compagno di squadra è l'argentino [[Leandro Mercado]]. Anche in questa stagione chiude il campionato portando a termine tutte le gare. Ottiene due piazzamenti a podio e due giri veloci; chiude la stagione al sesto posto con sessantanove punti.
Nel [[Campionato europeo Superstock 1000 2017|2017]] rimane nella Stock 1000, nel frattempo diventatodiventata [[Campionato Europeo Velocità|campionato europeo]]. Corre con lo stesso team e la stessa motocicletta, il nuovo compagno di squadra è l'australiano [[Mike Jones (motociclista)|Mike Jones]]. Al termine della stagione si laurea campione europeo Superstock avendo totalizzato 138 punti, otto in più del turco Razgatlıoğlu, classificatosi secondo.<ref>[http://www.motoblog.it/post/889838/superstock-1000-michael-ruben-rinaldi-campione-2017 Michael Ruben Rinaldi Campione Europeo Superstock 1000 2017] motoblog.it</ref> Rinaldi in questa stagione ottiene cinque piazzamenti a podio su nove gare in calendario, tra cui tre vittorie; oltre a quattro [[pole position]] e cinque giri veloci in gara. Con questo titolo Rinaldi diventa il decimo pilota italiano vincente in questo evento, dall'anno del suo riconoscimento da parte della [[Federazione Internazionale di Motociclismo]]. Nel [[campionato mondiale Superbike 2018|2018]] partecipa alle corse in territorio europeo del [[Campionato mondiale Superbike]] alla guida di una Ducati Panigale.<ref>[http://motosprint.corrieredellosport.it/news/sbk/superbike/2018/04/11-1458258/rinaldi_pronto_per_la_superbike_sono_tutti_qui_per_vincere_/?cookieAccept Rinaldi pronto per la Superbikeː "Sono tutti qui per vincere..."] motosprint.corrieredellosport.it</ref>
