La [[Chiesa Cattolicacattolica]] comprende tre parrocchie, facenti parte della [[Diocesi di Faenza]]: Fusignano (principale), San Savino e Maiano. Fusignano è sede di vicariato; alla sua giurisdizione appartengono anche le parrocchie, site fuori del territorio comunale, di Masiera, Bizzuno, Villa San Martino e [[Sant'Agata sul Santerno]]. Parte del territorio fusignanese appartiene alla parrocchia di Rossetta, la cui chiesa è sita in comune di [[Bagnacavallo]]. Edifici religiosi particolari siti nel territorio del comune sono la settecentesca Chiesa del Suffragio, la Chiesetta del Crocefisso ed una piccola cappella dedicata a Santa Lucia appartenente alla parrocchia di S. Maria in [[Alfonsine]]. Fusignano non ha conosciuto la presenza di [[Ordine religioso|ordini religiosi]] finché fu feudo dei Calcagnini, perché questi erano gelosi della propria giurisdizione e non volevano all'interno del loro piccolo stato delle entità autonome. A partire dal [[XIX secolo]] furono presenti tre Ordini di suore: le Dorotee, tra XIX e XX secolo, e le Salesiane nella seconda metà del Novecento, che si occupavano delle ragazze, e le suore di Carità, che sono rimaste a presidiare l'ospedale fino a metà del XX secolo. Tra le opere di carità si segnala l'Opera Pia Francesconi. Fondata dai fratelli Francesconi nella prima metà del Novecento, possiede beni propri e ha il compito di finanziare istituzioni culturali di impronta cattolica.
I [[Testimoni di Geova]] hanno una Casa del Regno capace di 120 posti.
