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In qualità di Esecutore il compito del giocatore è di riunire ciò che è rimasto del popolo Protoss e delle sue forze e di salvarlo dalle forze Zerg rimaste, dopo la distruzione dell’Unica Mente, grazie al sacrificio di Tassadar. Il suggerimento di Zeratul, è di spostarsi sul pianeta Shakuras tramite portale dimensionale, cosa che avverrà anche grazie a Fenix e Raynor che copriranno la fuga (e che rimarranno a combattere vicino al portale dal lato del pianeta Aiur).
Arrivati su Shakuras si scoprirà che alcuni Zerg sono riusciti a passare, e dunque la missione è di riprendere il controllo del portale stesso dal lato del pianeta Shakuras e di eradicare gli Zerg presenti nell’area di gioco. Terminata la missione, durante il briefing successivo si fa la conoscenza della Matriarca dei Templari Oscuri, [[Raszagal]], la quale spiega che per eradicare gli Zerg del tutto bisogna usare l’energia di un sacro e vecchissimo Tempio presente su Shakuras, creato dagli Xel’Naga, tramite l’ausilio di due particolari cristalli, di cui uno legato all’energia dei Templari Oscuri, mentre l’altro legato a quella dei Templari. Prima però la missione consiste nell’uccidere due cerebrati presenti a guardia del tempio stesso. Uccisi i due Cerebrati a guardia del tempio si fa vedere Kerrigan il quale dice a Zeratul che i Cerebrati appena uccisi erano anche suoi nemici, che è stato un bene ucciderli e che c’è qualcosa che li minaccia tutti. E’ disposta a spiegare ciò che è a sua conoscenza solo una volta portata alla cittadella dei Templari Oscuri e così avviene.
L’incontro avviene in orbita sopra il pianeta Braxis, con Kerrigan che spiega che su Char si sta sviluppando una nuova Unica Mente, in quanto alcuni Cerebrati rinnegati, sotto la guida di Daggoth si sono fuse per formare una Unica Mente che al momento è allo stato embrionale, e che sarebbe opportuno ucciderla prima che maturi, la missione principale rimane comunque trovare i cristalli Uraj e Khalis, da usare all’interno del Tempio su Shakuras (nel frattempo il Giudicatore Aldaris che stava partecipando al briefing, dopo essere zittito dalla Matriarca, perché aveva protestato contro una collaborazione con Kerrigan, se ne va via). Una volta recuperato il cristallo Uraj su Braxis, pianeta sotto controllo Terran perché abbandonato dai protoss tempo prima, durante il briefing successivo si fa sentire l’Ammiranglio Alexei Stukov del Direttorio della Terra Unita il quale è li per assumere il controllo del Dominio Terran e delle Colonie Esterne, il quale ha sequestrato le navi e di tutto ciò di cui i Protoss si sono impadroniti su Braxis. La missione perciò è di distruggere i generatori su una piattaforma orbitante Braxis per forzare il blocco del DTU. Distrutti i generatori si procede al recupero del secondo cristallo chiamato Khalis (a scelta del giocatore è possibile invece procedere ad attaccare la nuova Unica Mente per indebolirla) sul pianeta Char. Terminata la missione, durante il successivo briefing, la Matriarca, accusa Aldaris di aver dato vita ad una ribellione contro i Templari Oscuri e chiunque collabori con loro, e ordina l’esecutore di trovare Aldaris e di ucciderlo, poco dopo Zeratul avverte che una decisione così forte non è tipico della Matriarca e che quindi c’è qualcosa che non va. Trovato Aldaris, Zeratul gli chiede di tornare dalla loro parte e Aldaris tenta di spiegare al Templare Oscuro che la Matriarca è stata influenzata da Kerrigan. In quel preciso istante appare Kerrigan stessa, che uccide Aldaris e Zeratul, infuriato, dice a Kerrigan di andarsene da quel mondo. Durante il briefing si parla dell’inganno di Kerrigan, con la Matriarca che ha ripreso il controllo della sua mente. La missione è di portare entrambi i cristalli [[Xel'naga]] recuperati su Char e Braxis e di portarli nell’area del tempio, che nel frattempo si è ripopolata di Zerg. Una volta portato entrambi i cristalli dal tempio verrà sprigionata una fortissima energia che sparrezà gli Zerg da [[StarCraft (serie)#Cosmologia|Shakuras]].
=== Campagna Terran Brood War ===
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