Nel 2012 ritornò al ruolo di coordinatore dell'attacco e anche allenatore dei quarterback dei Patriots. Nel 2014 ha vinto con i Patrioits il [[Super Bowl XLIX]] contro i [[Seattle Seahawks 2014|Seattle Seahawk]]<nowiki/>s e nel 2016 il [[Super Bowl LI]] contro gli [[Atlanta Falcons 2016|Atlanta Falcons]]. Nel 2017 McDaniels fu tra i candidati a diventare il nuovo capo allenatore dei [[Los Angeles Rams 2017|Los Angeles Rams]]<ref>{{Cita web|url=https://www.foxsports.com/stories/nfl/nfl-rumors-josh-mcdaniels-is-rams-top-head-coach-target|titolo=NFL RUMORS: JOSH MCDANIELS IS RAMS' TOP HEAD COACH TARGET|sito=Fox Sports|data=17 dicembre 2016|lingua=en|accesso=5 maggio. 2022}}</ref>.
Il 6 febbariofebbraio 2018 McDaniels fu annunciato come nuovo capo allenatore degli [[Indianapolis Colts 2018|Indianapolis Colts]]<ref>{{Cita web|autore=Mike Wells|url=http://www.espn.com/nfl/story/_/id/22344934/indianapolis-colts-hire-josh-mcdaniels-head-coach|titolo=Colts hire Josh McDaniels as head coach|sito=ESPN.com|data=6 febbraio 2018|accesso=5 maggio 2022|lingua=en}}</ref> ma, lo stesso giorno, McDaniels ha rinunciato e annunciato che invece avrebbe continuato con i Patriots<ref>{{Cita web|url=https://www.colts.com/news/statement-by-the-indianapolis-colts-on-head-coach-search-20343346|titolo=Statement By The Indianapolis Colts On Head Coach Search|sito=Colts.com|data=6 febbraio 2019|accesso=5 maggio 2022|lingua=en}}</ref><ref>{{Cita web|url=http://www.espn.com/nfl/story/_/id/22349872/josh-mcdaniels-spurns-indianapolis-colts-remain-new-england-patriots|titolo=Josh McDaniels changes mind, jilting Colts to stay with Pats|autore=Adam Schefter|accesso=5 maggio 2022|lingua=en}}</ref>, cosa che portò all'abbandono da parte del suo agente<ref>{{Cita web|url=http://www.espn.com/nfl/story/_/id/22356955/josh-mcdaniels-agent-bob-lamonte-quitting-colts-mess|titolo=Josh McDaniels' agent quits after being stunned by decision|sito=ESPN.com|data=7 febbraio 2018|accesso=5 maggio 2022|lingua=en}}</ref>. I Patriots a fine stagione vinsero il [[Super Bowl LIII]], il terzo campionato conquistato con McDaniels come coordinatore dell'attacco.
Il 31 gennaio 2022 è stato assunto come capo allenatore dai [[Las Vegas Raiders 2022|Las Vegas Raiders]]<ref>{{Cita web|url=https://www.raiders.com/news/raiders-hire-josh-mcdaniels-as-head-coach|titolo=Raiders announce Josh McDaniels as next Head Coach|sito=Raiders.com|data=31 gennaio 2022|lingua=en|accesso=5 maggio 2022}}</ref>.
