[[Image:Lake Peten Itza NASA.jpg|thumb|280px|Il lago Petén Itzá visto dallo spazio]]
Questo lago è anche un paradiso naturale, con oltre 100 importanti specie ittiche indigene quali il ''[[Petenia|petenia splendida]]'', vari [[coccodrillo|coccodrilli]] (''[[crocodylusCrocodylus moreletii]]'' e ''[[crocodylusCrocodylus acutus]]''), [[Panthera onca|giaguari]], [[Puma concolor|puma]], [[Odocoileus virginianus|cervi dalla coda bianca]], [[Mazama americana|mazama rossi]] e numerose specie di uccelli, tra cui [[Psittaciformes|pappagalli]], [[Ramphastidae|tucani]] e [[Ara (nome comune)Arini|are]]. Sulla costa settentrionale si trova il ''biotopo protetto di Cerro Cahui'', una riserva naturale di [[Farfalla|farfalle]] di 6,5 km² che ospita tucani, [[Ateles geoffroyi|atele di Geoffroy]], [[alouatta]] (''[[alouattaAlouatta palliata]]'', ''[[alouattaAlouatta pigra]]'') e molte altre specie tipiche delle [[Foresta pluviale|foreste pluviali]].
