Dal [[2007]] fa parte del team che dirige il settore giovanile dell'[[AFC Ajax|Ajax]] e dal [[2004]] è membro del consiglio direttivo del [[Football Club Volendam|Volendam]].
Il [[28 novembre]] [[2011]] [[Johan Cruijff]], membro del consiglio direttivo dell'[[AFC Ajax|Ajax]], insieme agli allenatori del vivaio Wim Jonk, [[Dennis Bergkamp]], [[Bryan Roy]], [[Ronald de Boer]], [[John Bosman]], [[Jaap Stam]], [[Marc Overmars]], [[Michel Kreek]], [[Orlando Trustfull]] e [[Dean Gorre]] ha annunciato che avrebbe adito le vie legali ritenendo che gli ingaggi dei tre nuovi dirigenti [[Louis van Gaal]], [[Martin Sturkenboom]] e [[Danny Blind]] violino la politica a livello tecnico adottata dal club.<ref>{{Cita news|url=http://www.repubblica.it/sport/calcio/calciomercato/2011/11/28/news/ajax_cruyff_van_gaal_tribunale-25739617/|titolo=Cruyff contro van Gaal - Si va in tribunale|editore=[[La Repubblica]]|data= 28 novembre 2011}}</ref><ref>{{Cita news|autore = |titolo = Cruijff vuole fare causa all'Ajax|pubblicazione = [[La Gazzetta dello Sport|Extra Time]]|giorno = 29|mese = 11|anno = 2011|pagina = 10}}</ref> Il [[7 febbraio]] [[2012]] è stata pronunciata la sentenza secondo la quale la nomina di van Gaal a direttore generale dei lancieri sarebbe stata irregolare e così il [[10 febbraio]] il board (quattro consiglieri più Cruijff, che resta come consulente) si è dimesso insieme a [[Martin Sturkenboom]] e [[Danny Blind]].<ref>{{Cita news|autore = |titolo = Crisi Ajax, si dimette il board|pubblicazione = [[La Gazzetta dello Sport]]|giorno = 10|mese = 02|anno = 2012|pagina = 19}}</ref>
