RNA ribosomiale: differenze tra le versioni
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[[File:RF00177.jpg|thumb|RNA ribosomiale]]
L''''RNA ribosomiale''' (o '''RNA ribosomale''', abbreviato come '''rRNA''') è la tipologia più abbondante di RNA presente nella cellula. Non codifica direttamente le proteine, ma è il componente essenziale (circa i due terzi) dei [[ribosoma|ribosomi]], macchine catalitiche che provvedono all'assemblaggio delle proteine, presenti in tutte le [[cellula|cellule]] viventi.
Il ribosoma è una struttura che si auto-assembla in due [[subunità]] [[ripiegamento (chimica)|ripiegate]] (la subunità maggiore e la subunità minore) costituite dall'RNA ribosomiale, in presenza di 70-80 [[proteina|proteine]] ribosomiali, che si trovano all'esterno oppure nelle cavità presenti all'interno dell'rRNA ripiegato.
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La funzione dell'rRNA è fornire un meccanismo per la decodifica dell'[[RNA messaggero|mRNA]] in [[amminoacidi]] (al centro della subunità minore del ribosoma) ed interagire con il [[RNA transfer|tRNA]] durante la [[sintesi proteica]], provvedendo all'attività della [[peptidiltransferasi]], che avviene nella subunità maggiore. L'esattezza della traduzione è dovuta al lavoro di entrambe le subunità.
Per i geni dell'rRNA è stata dimostrata la ''dominanza nucleolare''. In alcuni organismi, in particolare le piante, quando due nuclei si combinano in una singola cellula durante l'ibridazione, l'organismo che ne deriva può "scegliere" un set di geni per la trascrizione dell'rRNA. L'altro set viene soppresso e generalmente non viene trascritto, anche se a volte può essere "riattivato".▼
Le caratteristiche dell'RNA ribosomiale sono importanti per la [[medicina]] e per lo studio dell'[[evoluzione]]:▼
== Confronto fra procarioti ed eucarioti ==
* L'rRNA è il bersaglio di molti [[antibiotico|antibiotici]]: [[cloramfenicolo]], [[eritromicina]], kasugamicina, micrococcina, paromicina, [[Ricina (proteina)|ricina]], sarcina, spectinomicina, streptomicina e tiostreptone;▼
[[File:Ribosome shape.png|thumb|Struttura e morfologia del ribosoma 70S di ''[[Escherichia coli]]''. Per la subunità maggiore: in rosa le proteine ribosomali, in rosso scuro il 23S RRNA, in rosso arancio il 5S rRNA. Per la subunità mimore: in blu scuro il 16S rRNA.]]
Come già accennato, in entrambi i domini l'rRNA può essere suddiviso in due subunità: quella maggiore e quella minore.<ref>Di seguito viene riportata la chiave di lettura della tabella:
* L'rRNA è il componente più conservato (che ha subito meno variazioni nel corso dell'evoluzione) in tutte le cellule. Per questa ragione, i geni che codificano per l'rRNA vengono sequenziati per identificare il gruppo [[tassonomia|tassonomico]] di un organismo, per riconoscere i gruppi correlati e stimare il tasso di divergenza tra le varie specie.▼
*Le S rappresentano le unità di [[Svedberg]];
* ''nt'' rappresenta la lunghezza in [[nucleotide|nucleotidi]] degli rRNA.</ref>
{| class="wikitable"
| '''Dominio''' || '''Grandezza''' || '''Subunità maggiore''' || '''Subunità minore '''
|-
| Procarioti || 70S || 50S (5S : 120 nt, 23S : 2906 nt) || 30S (16S : 1542 nt)
|-
| Eucarioti || 80S || 60S (5S: 121 nt,<ref>{{cita web | url = http://www.ncbi.nlm.nih.gov/nuccore/NR_023379.1 | titolo=''Homo sapiens'' 5S ribosomal RNA|lingua=en|editore=National Center for Biotechnology Information}}</ref> 5.8S: 156 nt,<ref>{{cita web | url = http://www.ncbi.nlm.nih.gov/nuccore/NR_003285.2 | lingua=en|titolo = ''Homo sapiens'' 5.8S ribosomal RNA|editore=National Center for Biotechnology Information}}</ref> 28S: 5070 nt<ref>{{cita web | url = http://www.ncbi.nlm.nih.gov/nuccore/NR_003287.2 | lingua=en|titolo= ''Homo sapiens'' 28S ribosomal RNA|editore=National Center for Biotechnology Information }}</ref>) || 40S (18S: 1869 nt<ref>{{cita web | url = http://www.ncbi.nlm.nih.gov/nuccore/NR_003286.2|editore=National Center for Biotechnology Information | lingua=en|titolo= ''Homo sapiens'' 18S ribosomal RNA }}</ref>)
|}
Nei [[Bacteria]], negli [[Archaea]], nei [[mitocondri]] e nei [[cloroplasti]], la subunità minore contiene l'rRNA 16S, mentre la subunità maggiore ne contiene due specie: il 5S ed il 23S.
Nei batteri i geni ribosomiali 16S, 23S e 5S sono tipicamente organizzati in un [[operone]]. Possono esserci una o più copie dell'operone disperse nel [[genoma]] (''[[Escherichia coli]]'' ad esempio ne ha sette). Gli Archaea possono contenere sia un singolo operone di rDNA sia copie multiple dello stesso operone.
Al contrario gli [[Eukaryota]] hanno generalmente molte copie dei geni dell'rRNA ripetute in serie. Negli esseri umani sono presenti approssimativamente 300-400 ripetizioni di rRNA in cinque gruppi (sui [[cromosoma|cromosomi]] 13, 14, 15, 21 e 22). Nella maggior parte degli eucarioti la subunità ribosomiale minore contiene l'rRNA 18S, mentre la subunità maggiore ne contiene tre specie diverse: il 5S, il 5,8S ed il 25S/28S.
== Importanza dell'RNA ribosomiale==
▲Per i geni dell'rRNA è stata dimostrata la ''dominanza nucleolare''. In alcuni organismi, in particolare le piante, quando due nuclei si combinano in una singola cellula durante l'ibridazione, l'organismo che ne deriva può "scegliere" un set di geni per la trascrizione dell'rRNA. L'altro set viene soppresso e generalmente non viene trascritto, anche se a volte può essere "riattivato".
▲Le caratteristiche dell'RNA ribosomiale sono importanti per la [[medicina]] e per lo studio dell'[[evoluzione]]:
▲* L'rRNA è il bersaglio di molti [[antibiotico|antibiotici]]: [[cloramfenicolo]], [[eritromicina]], kasugamicina, micrococcina, paromicina, [[Ricina (proteina)|ricina]], sarcina, spectinomicina, streptomicina e tiostreptone;
▲* L'rRNA è il componente più conservato (che ha subito meno variazioni nel corso dell'evoluzione) in tutte le cellule.<ref name="Smit2007">{{cita pubblicazione|autore=Smit S, Widmann J, Knight R |titolo=Evolutionary rates vary among rRNA structural elements |editore=Nucleic Acids Res |volume=35 |issue=10 |pagine=3339–54 |anno=2007 |pmc=1904297 |doi=10.1093/nar/gkm101 |pmid=17468501}}</ref> Per questa ragione, i geni che codificano per l'rRNA vengono sequenziati per identificare il gruppo [[tassonomia|tassonomico]] di un organismo, per riconoscere i gruppi correlati e stimare il tasso di divergenza tra le varie specie.
== Note ==
<references/>
== Voci correlate ==
* [[RNA]]
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