Promotore (biologia): differenze tra le versioni
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== Struttura dei promotori ==
I promotori, costituiti da DNA a doppia [[elica (geometria)|elica]], si trovano a monte del gene di cui iniziano la trascrizione e sono lunghi circa 200 [[base pair|bp]]; l'RNA polimerasi riconosce il DNA a doppia elica e si lega ad esso, anche se soltanto un'elica verrà utilizzata come stampo per la trascrizione. I promotori più efficienti sono chiamati ''promotori forti'', dove per forza di un promotore
I promotori di tutti i geni che codificano per proteine sono stati analizzati confrontando le sequenze di DNA a monte di numerosi geni strutturali e verificando
== Tipi di promotore ==
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Il ''promotore della RNA polimerasi I'' è composto da due sequenze:
'''Nucleo del promotore''': si estende da -45 a +20 ed è ricco in GC, tranne che per una sequenza ricca in AT vicina
'''Elemento a monte del promotore (Upstream Promoter Element)''': si estende da -180 a -107 ed è ricco in GC. Ad esso si lega la proteina UBF.
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'''Nucleo del promotore''': costituito da una serie di sequenze che agiscono in cis necessarie per l'inizio della trascrizione. Lega i fattori di trascrizione basali o generali(TFII)ed è costituito essenzialmente da cinque elementi:
*BRE(TFIIB Recognition Element): elemento riconosciuto da TFIIB ed è localizzato a circa -35
*TATA box: sito di legame per la proteina TBP in grado di promuovere da sola
*Sequenza iniziatore(Inr): presente sul sito d'inizio della trascrizione e insieme alla TATA box produce un effetto sinergico
*MTE(Motif Ten Element): funziona solo se è presente anche INR; può funzionare anche in assenza della TATA box o di DPE e se presente con la TATA box o DPE si ha un effetto sinergico
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== Promotore Alternativo ==
Alcuni geni hanno dei promotori alternativi, ovvero siti di legame della RNA polimerasi su uno stesso gene opzionale rispetto a quello principale.
Essi danno origine a diverse versioni del trascritto a partire dallo stesso gene e permettono di ottenere una molecola di RNA che differisce
I promotori alternativi sono presenti nel 23% geni umani (in media dal 10-20%) e a partire da un primo [[enhancer ]] che può avere parti impazzite
alternative;
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