L'università venne fondata nel 1696 ed era chiamata ''Preußiche Akademie der Künste'' (''Accademia prussiana delle belle arti''). Nel tempo ha continuato la tradizione di insegnamento delle arti ed è stata diretta da personaggi celebri dell'arte tedesca, come [[Johann Gottfried Schadow]] e [[Anton von Werner]]. Nel corso del tempo l'università subì numerose riforme dell'ordinamento, infatti tra il 1875 e il 1882 venne divisa in due distinte sezioni: l<nowiki>'</nowiki>''Hochschule für Bildende Künste'' (Istituto superiore per le arti figurative'') e la ''Hochschule für Musik und Darstellende Kunst'' (Istituto superiore per la musica e la recitazione). Tra il 1897 e il 1902 vennero costruiti una serie di edifici barocchi per le due sezioni dell'università; il progetto venne affidato a [[Heinrich Kayser]] e [[Karl von Großheim]]. Dopo i bombardamenti della guerra sono rimasti solo due edifici. Nel 1955 è stata costruita una nuova sala concerti, al posto di quella distrutta dai bombardamenti, su progetto di [[Paul Baumgarten]].
