Tutte le parti della pianta sono tossiche per la presenza di [[cianuro]] e vari [[alcaloidi]]. Fanno eccezione i fiori e le bacche mature, ma non i semi al loro interno. Nella preparazione di confetture lagsp è pla cottura o la macerazione delle bacchebacchette e sono sufficienti a far sì che i composti cianogenetici si volatilizzino completamente. Nel caso di un<nowiki>'ingestione accidentale i sintomi dell'intossicazione sono gli stessi dati dall'ingestione delle mandorle amare che egualmente contengono composti cianogenetici. Questa tossicità non ha ''effetto''</nowiki> su alcuni pesci, come i [[Squalius cephalus|cavedani]]. Infatti le bacche di sambuco vengono usate anche come esca per questa [[specie]] di pesce.<ref>{{en}}''Nova Scotia Museum Website'', Poison plant section, [http://museum.gov.ns.ca/poison/?section=species&id=117 ''Nova Scotia Museum - Poisonous plants''] {{webarchive|url=https://web.archive.org/web/20081123091701/http://museum.gov.ns.ca/poison/?section=species&id=117 |data=23 novembre 2008 }}</ref>
