Prorocentrales è un ordine di dinoflagellate.

Diversamente da altri gruppi nei quali sono presenti due flagelli ventrali, questo ordine è costituito da organismi con due flagelli apicali. Un flagello si estende in avanti mentre l'altro decorre circolarmente sulla base; gli organismi di questo ordine non possiedono solchi flagellari. Questa disposizione prende il nome di morfotipo desmoconte, diversamente dal morfotipo dinoconte presente in altri gruppi. Le Prorocentrales possono essere quindi definite desmoflagellate ed in qualche classificazione tassonomica formano una classe a parte, quella delle Desmophyceae.

Tutti i gruppi appartenenti all'ordine Prorocentrales hanno cloroplasti ed una teca, costituita da due grandi placche unite da una sutura sagittale. Tale struttura è un carattere condiviso con le Dinophysiales, di cui sono probabilmente un sister group. 

Studi di tassonomia molecolare basati sull'rRNA evidenziano l'esistenza di due gruppi nel genere Prorocentrum. La filogenesi di questo genere basata su questo carattere molecolare rimane tuttavia non ancora ben risolta.