Amplificazione isotermica mediata dal loop di trascrizione inversa
L'amplificazione isotermica mediata da loop di trascrizione inversa (RT-LAMP) è un metodo di amplificazione degli acidi nucleici in una sola fase per moltiplicare sequenze specifiche di RNA. È usato per diagnosticare malattie infettive causate da virus a RNA.[1]
Questa tecnica combina il rilevamento del DNA LAMP[2] con la trascrizione inversa, producendo cDNA dall'RNA prima di eseguire la reazione.[3] RT-LAMP non richiede cicli termici (a differenza della PCR) e viene eseguita a una temperatura costante tra 60 e 65 °C.
RT-LAMP è utilizzato nel rilevamento di virus a RNA ( Gruppo II, IV e V nel sistema di classificazione dei virus di Baltimora), come il virus SARS-CoV-2[4][5] e il virus Ebola.[6]
Vantaggi modifica
Svantaggi modifica
Note modifica
- ^ Mori Y, Notomi T, Loop-mediated isothermal amplification (LAMP): a rapid, accurate, and cost-effective diagnostic method for infectious diseases, in J. Infect. Chemother., vol. 15, n. 2, aprile 2009, pp. 62–9, DOI:10.1007/s10156-009-0669-9, PMC 7087713, PMID 19396514. URL consultato il 21 settembre 2020.
- ^ Notomi T, Okayama H, Masubuchi H, Yonekawa T, Watanabe K, Amino N, Hase T, Loop-mediated isothermal amplification of DNA, in Nucleic Acids Res., vol. 28, n. 12, giugno 2000, pp. E63, DOI:10.1093/nar/28.12.e63, PMC 102748, PMID 10871386. URL consultato il 21 settembre 2020.
- ^ Fu S, Qu G, Guo S, Ma L, Zhang N, Zhang S, Gao S, Shen Z, Applications of loop-mediated isothermal DNA amplification, in Appl. Biochem. Biotechnol., vol. 163, n. 7, aprile 2011, pp. 845–50, DOI:10.1007/s12010-010-9088-8, PMID 20844984. URL consultato il 21 settembre 2020.
- ^ (EN) Max J. Kellner, James J. Ross, Jakob Schnabl, Marcus P. S. Dekens, Robert Heinen, Irina Grishkovskaya, Benedikt Bauer, Johannes Stadlmann, Luis Menéndez-Arias, Robert Fritsche-Polanz e Marianna Traugott, A rapid, highly sensitive and open-access SARS-CoV-2 detection assay for laboratory and home testing, in bioRxiv, 23 luglio 2020, pp. 2020.06.23.166397, DOI:10.1101/2020.06.23.166397.
- ^ Matthew A. Lalli, S Joshua Langmade, Xuhua Chen, Catrina C. Fronick, Christopher S. Sawyer, Lauren C. Burcea, Michael N. Wilkinson, Robert S. Fulton, Michael Heinz, William J. Buchser, Richard D. Head, Robi D. Mitra e Jeffrey Milbrandt, Rapid and extraction-free detection of SARS-CoV-2 from saliva with colorimetric LAMP, in Medrxiv : The Preprint Server for Health Sciences, 2020, DOI:10.1101/2020.05.07.20093542, PMC 7273276, PMID 32511508.
- ^ (EN) Yohei Kurosaki, N’Faly Magassouba, Olamide K. Oloniniyi, Mahamoud S. Cherif, Saori Sakabe, Ayato Takada, Kenji Hirayama e Jiro Yasuda, Development and Evaluation of Reverse Transcription-Loop-Mediated Isothermal Amplification (RT-LAMP) Assay Coupled with a Portable Device for Rapid Diagnosis of Ebola Virus Disease in Guinea, in PLOS Neglected Tropical Diseases, vol. 10, n. 2, 22 febbraio 2016, pp. e0004472, DOI:10.1371/journal.pntd.0004472, ISSN 1935-2735, PMC 4764121, PMID 26900929.
