Giunzione di Holliday
Una giunzione di Holliday è una struttura mobile a croce[1] composta da quattro filamenti di DNA, che prende il nome da Robin Holliday, che ne propose l'esistenza nel 1964[2][3] per spiegare un particolare scambio di materiale genetico nell'organismo Ustilago maydis, noto come ricombinazione omologa.
La mobilità di tali giunzioni è proprio dovuta al fatto che esse si formano tra sequenze omologhe, che permettono dunque lo scorrimento del DNA. Nei batteri, questo scorrimento è facilitato dal complesso di RuvABC o dalla proteina RecG, veri e propri motori molecolari in grado di utilizzare l'idrolisi dell'ATP per muovere le giunzioni. Per completare l'evento di ricombinazione, le giunzioni devono essere risolte: si devono cioè generare almeno due tagli nella struttura per rigenerare due duplex lineari.
Meccanismo molecolare modifica
L'evento cruciale del processo di ricombinazione è la connessione che si stabilisce fra due duplex di DNA. Quando le due emieliche di un cromosoma si rompono in punti corrispondenti, ciascun filamento lascia il suo partner e si appaia con il filamento complementare del cromosoma omologo. Lo scambio reciproco crea una connessione fra i due duplex di DNA, generando quella che è definita una molecola congiunta. Il punto in cui il singolo filamento di DNA passa da un duplex all'altro prende il nome di giunzione ricombinante. Nel sito di ricombinazione ciascun duplex ha una regione in cui ciascuno dei filamenti deriva da un diverso DNA parentale; tale regione è definita DNA ibrido o DNA eteroduplex.
Un'importante caratteristica di una giunzione ricombinante è la sua capacità di spostarsi lungo il duplex, in un processo che è detto migrazione della ramificazione. Il punto di ramificazione può migrare in entrambe le direzioni, mano a mano che un filamento viene spostato sull'altro. Ciò consente al punto di crossing-over nell'intermedio di ricombinazione di muoversi in entrambe le direzioni.
Il sistema Ruv modifica
Il passaggio più critico nella ricombinazione è la risoluzione delle giunzioni, fatto che determina se ci sarà una ricombinazione reciproca oppure un'inversione della struttura che lascia soltanto un breve tratto di DNA ibrido. La migrazione della ramificazione a partire dal sito di scambio determina la lunghezza della regione di DNA ibrido.
In Escherichia coli, le proteine che stabilizzano e risolvono le giunzioni di Holliday sono i prodotti dei geni Ruv.
- RuvA riconosce la struttura della giunzione di Holliday legandosi a tutti e quattro i filamenti di DNA nel punto di crossing-over, sul quale la proteina forma due tetrameri che chiudono il DNA ai due lati.
- RuvB è una elicasi esamerica con attività ATPasica, che costituisce il motore per la migrazione della ramificazione. Gli anelli esamerici di RuvB si legano intorno a ciascun duplex di DNA a monte del punto di crossing-over.
- Ruv C è una endonucleasi che taglia le giunzioni di Holliday, risolvendo gli intermedi della ricombinazione. Una sequenza tetranucleotidica asimmetrica (ATTG) costituisce un punto caldo per RuvC, che può dirigere la risoluzione verso una coppia particolare di filamenti.
È possibile che le proteine Ruv facciano parte di un resolvasoma, un complesso formato da enzimi che catalizzano sia la migrazione della ramificazione sia la risoluzione della giunzione. Le cellule di mammifero contengono complessi simili, senza però alcuna correlazione con le proteine batteriche.
Note modifica
- ^ (EN) Mahima Kaushik, Shikha Kaushik e Kapil Roy, A bouquet of DNA structures: Emerging diversity, in Biochemistry and Biophysics Reports, vol. 5, 1º marzo 2016, pp. 388–395, DOI:10.1016/j.bbrep.2016.01.013. URL consultato il 24 agosto 2022.
- ^ Liu Y, West S, Happy Hollidays: 40th anniversary of the Holliday junction, in Nat Rev Mol Cell Biol, vol. 5, n. 11, 2004, pp. 937-44, PMID 15520813.
- ^ Hays FA, Watson J, Ho PS, Caution! DNA Crossing: Crystal Structures of Holliday Junctions, in J Biol Chem, vol. 278, n. 50, 2003, pp. 49663–49666, DOI:10.1074/jbc.R300033200.
Voci correlate modifica
Altri progetti modifica
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Collegamenti esterni modifica
- (EN) Conformational Change of Holliday Junction, su ks.uiuc.edu.
- (EN) Holliday Structure in tetrahedral form, su engels.genetics.wisc.edu. URL consultato il 6 febbraio 2008 (archiviato dall'url originale il 12 luglio 2007).
