Nei playoff 2006, Samuel intercettò due passaggi e li ritornò in altrettanti [[touchdown]]: il primo nella vittoria sui [[New York Jets]] al primo turno e poi nella finale della [[American Football Conference|AFC]] contro gli [[Indianapolis Colts]] che estese il vantaggio dei Patriots sul 21–3.
Il 16516 gennaiofebbraio 2007, i Patriots applicarono la [[franchise tag]] su Samuel che il 27 agosto 2007 firmò un contratto annuale di 7,79 milioni di dollari<ref>{{cita news|lingua=en|url=https://www.usatoday.com/sports/football/nfl/patriots/2007-08-28-moves_N.htm |titolo= Pats, cornerback Samuel agree on deal |editore=USA Today |data=28 agosto 2007 |accesso=11 ottobre 2012 }}</ref>. Samuel terminò la stagione regolare 2007 con 6 intercetti, ritornandone uno in touchdown, venendo convocato per il Pro Bowl a aiutò i Patriots a raggiungere il [[Super Bowl XLII]] da imbattuti. Coi Patriots in vantaggio 14-10 cona meno di due minuti alla fine, Samuel si lasciò sfuggire quello che sarebbe stato l'intercetto della vittoria. Nella giocata successiva, [[Eli Manning]] completò un passaggio per David Tyree e la partita si concluse con la vittoria dei [[New York Giants]].
