Sul finire degli anni Venti la salute di Violante, da sempre cagionevole, peggiorapeggiorò. Nel 1731 le notizie relative alle sue condizioni di salute vengonovennero accolte a Siena con freddezza: le chiese espongonoesposero reliquie e icone sacre davanti cuialle quali raccogliersi in preghiera, ma i sudditi restanorestarono indifferenti. Alle 6 del mattino del 30 maggio 1731, Violante muoremorì a Firenze. Il popolo senese le concedeconcedette un formale cordoglio, occupato da altri eventi quali l'inaugurazione della nuova sala del [[teatro dei Rozzi]], il passaggio da Siena del cardinale [[Aldobrandini]] e quello dell'ambasciatore veneto spodestato. La città che l'aveva osannata al suo arrivo, stufa del suo lungo assenteismo, la congedacongedò con freddezza e indifferenza.
Per sua stessa volontà testamentaria, la sua salma non vienevenne seppellita nel pantheon della famiglia Medici in San Lorenzo, ma tumulata nella cripta della chiesa di Santa Teresa nel convento delle
Carmelitane scalze, dove era solita recarsi per i suoi ritiri spirituali. Sempre per sua volontà, il cuore invecevenne vieneinvece estratto e deposto ai piedi del defunto marito Ferdinando.<ref>{{Cita libro|nome = Gaetano|cognome = Cambiagi|titolo = L'antiquario fiorentino: osia, Guida per osservar con metodo le cose notabili della città di Firenze|url = https://books.google.it/books?id=oHxAAQAAMAAJ printsec=frontcover&hl=it&source=gbs_ge_summary_r&cad=0#v=onepage&q&f=false|accesso = 16 giugno 2015|data = 1781|editore = G. Cambiagi}}</ref> In epoca napoleonica, la salma verrà ricomposta in San Lorenzo, ma solo per un breve periodo: il 26 febbraio 1858, riformatosi in Toscana il granducato, il corpo verrà nuovamente spostato in Santa Teresa e il cuore rimesso nella tomba del marito, rispettando così le sue volontà testamentarie.<ref name=":0" />
