Caratteristica prominente dell'edificio è l'[[anfiteatro di anatomia]] (''Theatrum anatomicum''), istituitoprogettato da [[Olaus Rudbeck]] e costruito tra il 1662 e il 1663. L'anfiteatro si trova all'interno della particolare cupola al centro dell'edificio, sormontata da una [[meridiana]]. La cupola ha molte finestre, per fornire buona illuminazione all'interno, data la scarsa efficacia delle candele usate all'epoca. L'anfiteatro può ospitare fino a 200 persone. La struttura si ispira ai teatri classici di epoca greca, ma è elongata in altezza e non ha posti a sedere, per cui il pubblico assisteva stando in piedi sui palchi.
