SARS-CoV-2: differenze tra le versioni
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{{nota disambigua|la pandemia in corso|Pandemia di COVID-19 del 2019-2020}}
{{nota disambigua|la malattia causata da questo virus|COVID-19}}
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Il '''coronavirus 2 da sindrome respiratoria acuta grave''', abbreviato in '''SARS-CoV-2''' ([[acronimo]] dall'[[lingua inglese|inglese]] ''severe acute respiratory syndrome coronavirus 2''),<ref>{{cita news|url=http://www.ansa.it/canale_scienza_tecnica/notizie/biotech/2020/02/12/dopo-la-malattia-anche-il-coronavirus-ha-un-nome-sars-cov-2-_827d301b-9dfa-441a-a734-a00e1aef0777.html|pubblicazione=[[ANSA]]|titolo=Dopo la malattia anche il coronavirus ha un nome, Sars-CoV-2|data=12 febbraio 2020}}</ref><ref name=agi>{{cita news|url=https://www.agi.it/salute/news/2020-03-07/coronavirus-cosa-sapere-7372429/|titolo=Che cosa è il coronavirus|pubblicazione=[[Agenzia Giornalistica Italia]]|data=7 marzo 2020|accesso=18 luglio 2020}}</ref> in precedenza nominato '''nuovo coronavirus del 2019''' ('''''2019-nCoV''''',<ref>{{Cita web|lingua=en|titolo=Novel Coronavirus (2019-nCoV) Situation Report - 10|url=https://www.who.int/docs/default-source/coronaviruse/situation-reports/20200130-sitrep-10-ncov.pdf|editore=[[Organizzazione mondiale della sanità]]|data=30 gennaio 2020|accesso=18 luglio 2020}}</ref> o anche '''''2019 nCoV-ARD'''''),<ref>{{cita web|lingua=en|url=https://www.doh.gov.ph/doh-press-release/who-declares-2019-nCoV-ARD-public-health-emergency-of-international-concern|titolo=WHO declares 2019-nCoV ARD ‘Public Health Emergency of International Concern’; Phil Gov’t issues travel ban|data=31 gennaio 2020|accesso=18 luglio 2020}}</ref> è un [[Stipite virale|ceppo virale]] della specie [[SARS-related coronavirus]]/[[SARS-CoV]], facente parte del [[Genere (tassonomia)|genere]] ''[[Betacoronavirus]]'' ([[Famiglia (tassonomia)|famiglia]] [[Coronaviridae]]), sottogenere ''[[Sarbecovirus]]'', scoperto intorno alla fine del 2019; si tratta del settimo [[coronavirus]] riconosciuto in grado di infettare [[Homo sapiens|esseri umani]].<ref name=agi/> Il nome ufficiale dato dall'[[Organizzazione mondiale della sanità]] alla [[sindrome]] causata dal virus è [[COVID-19]] (abbreviazione dell'inglese ''COronaVIrus Disease-2019'').<ref>{{cita news|url=https://www.ilpost.it/2020/02/11/covid-19-nome-sindrome-nuovo-coronavirus-oms/|titolo=L'OMS ha chiamato COVID-19 la sindrome causata dal nuovo coronavirus|pubblicazione=[[il Post]]|data=11 febbraio 2020|accesso=11 febbraio 2020|urlarchivio=https://web.archive.org/web/20200211170925/https://www.ilpost.it/2020/02/11/covid-19-nome-sindrome-nuovo-coronavirus-oms/|dataarchivio=11 febbraio 2020|urlmorto=no}}</ref>
Il virus è stato sequenziato [[Genoma|genomicamente]] dopo un [[Nucleic Acid Test|test di acido nucleico]] effettuato su un [[Campione (laboratorio)|campione]] prelevato da un paziente colpito da una [[polmonite]], di cui non si conosceva la causa, all'inizio della [[Pandemia di COVID-19 del 2019-2020|pandemia del 2019-2020 a Wuhan]].<ref>{{Cita web|url=http://www.xinhuanet.com/english/2020-01/09/c_138690570.htm|titolo=New-type coronavirus causes pneumonia in Wuhan: expert|sito=Xinhua|data=9 gennaio 2020|accesso=23 gennaio 2020}}</ref><ref>http://www.chinacdc.cn/dfdt/201912/t20191226_209404.html</ref><ref>https://platform.gisaid.org/epi3/start/CoV2020</ref>
Al 12 marzo 2020 non sono ancora ben chiare molte sue caratteristiche e, sebbene sia stata accertata la sua capacità di trasmettersi da una persona a un'altra, permangono delle incertezze sulle esatte modalità di trasmissione e sulla [[patogenicità]].<ref>{{cita web|lingua=en|url=https://www.ecdc.europa.eu/sites/default/files/documents/RRA-sixth-update-Outbreak-of-novel-coronavirus-disease-2019-COVID-19.pdf|titolo=Novel coronavirus disease 2019 (COVID-19) pandemic: increased transmission in the EU/EEAand the UK – sixth update|data=12 marzo 2020|accesso=18 luglio 2020}}</ref>
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Il [[genoma]] del SARS-CoV-2 presenta l'89% di [[Nucleotide|nucleotidi]] identici a quelli del [[SARS-like-CoVZXC21]] (diffuso nei [[Chiroptera|pipistrelli]]) e l'82% identici a quelli del SARS-CoV; tuttavia solo il 40% degli [[Amminoacido|aminoacidi]] coincide con quelli dei coronavirus legati alla [[SARS]].<ref>{{en}} Chan JF, Kok KH, Zhu Z, Chu H, To KK, Yuan S, Yuen KY, ''[https://www.tandfonline.com/doi/full/10.1080/22221751.2020.1719902 Genomic characterization of the 2019 novel human-pathogenic coronavirus isolated from a patient with atypical pneumonia after visiting Wuhan]''</ref>
Non è ancora noto come il virus potrebbe essersi trasferito da ospiti a [[Ectotermia|sangue freddo]] a ospiti a [[Endotermia (biologia)|sangue caldo]].<ref name="reccom.org">{{Cita web|url=https://www.reccom.org/2020/01/23/sintomi-e-probabile-origine-del-coronavirus-di-wuhan/|titolo=Sintomi e probabile origine del coronavirus di Wuhan|autore=Massimo Zito|editore=Reccom Magazine|data=23 gennaio 2020|accesso=23 gennaio 2020}}</ref> Un evento di [[ricombinazione omologa]] può aver mescolato un virus del sottogenere A (''[[Embecovirus]]'', virus simili a SARS Bat CoVZC45 e CoVZXC21) con la proteina legante del recettore di un [[Betacoronavirus|Beta-CoV]] ancora sconosciuto.<ref name="onlinelibrary.wiley.com">{{Cita pubblicazione|autore=|nome=Wei|cognome=Ji|titolo=Homologous recombination within the spike glycoprotein of the newly identified coronavirus may boost cross-species transmission from snake to human|rivista=Journal of Medical Virology|lingua=en|accesso=23 gennaio 2020|doi=10.1002/jmv.25682|url=https://onlinelibrary.wiley.com/doi/abs/10.1002/jmv.25682|nome2=Wei|cognome2=Wang|nome3=Xiaofang|cognome3=Zhao}}</ref><ref name="theconversation.com">{{Cita web|url=http://theconversation.com/snakes-could-be-the-original-source-of-the-new-coronavirus-outbreak-in-china-130364|titolo=Snakes could be the original source of the new coronavirus outbreak in China|autore=Guangxiang “George” Luo, Haitao Guo e Shou-Jiang Gao|sito=The Conversation|data=22 gennaio 2020|lingua=en|accesso=23 gennaio 2020}}</ref>
=== Genoma virale ===
[[File:2019-nCoV genome.svg|thumb|upright=1.8|Organizzazione del [[genoma]] del SARS-CoV-2]]
Il 22 gennaio 2020, il ''Journal of Medical Virology'' ha pubblicato un rapporto con analisi genomica indicante che i serpenti nell'area di Wuhan sono "tra gli animali selvatici, il più probabile serbatoio" per il virus, ma sono necessarie ulteriori ricerche.<ref
Tuttavia, il modo in cui il virus potrebbe adattarsi sia agli ospiti a [[Ectotermia|sangue freddo]] che a quelli a [[Endotermia (biologia)|sangue caldo]] rimane un mistero.<ref
Infatti, le sequenze del betacoronavirus di Wuhan mostrano somiglianze con i [[betacoronavirus]] trovati nei [[pipistrelli]];<ref name="NatureZhou">{{cita pubblicazione|autore= Peng Zhou e al.|titolo=A pneumonia outbreak associated with a new coronavirus of probable bat origin|rivista=Nature|data=3 febbraio 2020|numero=579|pp=270-273|url=https://www.nature.com/articles/s41586-020-2012-7|doi=10.1038/s41586-020-2012-7}}</ref> tuttavia, il virus è geneticamente distinto da altri coronavirus come quello correlato alla [[SARS|sindrome respiratoria acuta grave]] (SARS) e il coronavirus correlato alla [[sindrome respiratoria mediorientale da Coronavirus]] (MERS).<ref name=":1">{{Cita web|url=https://www.who.int/health-topics/coronavirus|titolo=Coronavirus|sito=who.int|lingua=en|accesso=16 gennaio 2020|urlarchivio=https://web.archive.org/web/20200120214550/https://www.who.int/health-topics/coronavirus|dataarchivio=20 gennaio 2020}}</ref>
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Come altri coronavirus, SARS-CoV-2 presenta quattro [[proteine]] strutturali, note: come proteina S (spinula), E (involucro), M (membrana) e N ([[nucleocapside]]); la proteina N contiene il [[genoma]] dell'[[RNA]] mentre le proteine S, E e M creano insieme l'inviluppo virale.<ref name="WuStructure">{{Cita pubblicazione|coautori=Wu C, Liu Y, Yang Y, Zhang P, Zhong W, Wang Y, Wang Q, Xu Y, Li M, Li X, Zheng M, Chen L, Li H|titolo=Analysis of therapeutic targets for SARS-CoV-2 and discovery of potential drugs by computational methods |rivista=Acta Pharmaceutica Sinica B|data=February 2020| doi=10.1016/j.apsb.2020.02.008}}</ref> La proteina spinula<ref>http://www.treccani.it/vocabolario/spinula</ref>, che è stata analizzata a livello [[atomo|atomico]] mediante [[microscopia crioelettronica]],<ref name="SCI-20200219" /><ref name="GZM-20200220">{{Cita web|coautori=Mandelbaum RF |titolo=Scientists Create Atomic-Level Image of the New Coronavirus's Potential Achilles Heel |url=https://gizmodo.com/scientists-create-atomic-level-image-of-the-new-coronav-1841795715 |data=19 febbraio 2020 |sito=Gizmodo |accesso=13 marzo 2020 |urlarchivio=https://web.archive.org/web/20200308070019/https://gizmodo.com/scientists-create-atomic-level-image-of-the-new-coronav-1841795715 |dataarchivio=8 marzo 2020 |urlmorto=n }}</ref> è quella che permette al virus di attaccarsi alla [[membrana cellulare|membrana]] di una cellula ospite.<ref name="WuStructure" />
[[File:Coronavirus_virion_structure.svg|miniatura|Struttura del virione]]
Gli esperimenti di modellizzazione delle proteine sulla proteina S del virus hanno suggerito che SARS-CoV-2 ha affinità con i recettori dell'[[enzima 2 di conversione dell'angiotensina]] (ACE2) delle cellule umane per usarle come "porta" di entrata nella cellula.<ref>{{Cita pubblicazione|coautori= Xu X, Chen P, Wang J, Feng J, Zhou H, Li X, Zhong W, Hao P |titolo= Evolution of the novel coronavirus from the ongoing Wuhan outbreak and modeling of its spike protein for risk of human transmission |rivista= Science China Life Sciences |volume= 63 |numero= 3 |pp= 457–460 |data= March 2020 | pmid = 32009228 | doi = 10.1007/s11427-020-1637-5 }}</ref>
Al 22 gennaio 2020, un gruppo cinese che lavorava con il genoma virale completo e un gruppo statunitense che utilizzava metodi di genetica inversa, hanno dimostrato indipendentemente che ACE2 era in grado di agire da recettore per SARS-CoV-2.<ref name="NatureZhou" /><ref name="Letco22Jan2020">{{Cita pubblicazione|coautori=Letko M, Munster V|titolo=Functional assessment of cell entry and receptor usage for lineage B β-coronaviruses, including 2019-nCoV|data=January 2020 |rivista=[[bioRxiv]] |tipo=preprint |doi=10.1101/2020.01.22.915660 }}</ref><ref>{{Cita pubblicazione|coautori= Letko M, Marzi A, Munster V |titolo= Functional assessment of cell entry and receptor usage for SARS-CoV-2 and other lineage B betacoronaviruses |rivista= Nature Microbiology |data= February 2020 | pmid = 32094589 | doi = 10.1038/s41564-020-0688-y }}</ref><ref>{{Cita pubblicazione|coautori=((El Sahly HM))|titolo=Genomic Characterization of the 2019 Novel Coronavirus |url=https://www.jwatch.org/na50823/2020/02/06/genomic-characterization-2019-novel-coronavirus |rivista=[[The New England Journal of Medicine]] |accesso=9 febbraio 2020}}</ref><ref name="Gralinski2020">{{Cita pubblicazione|coautori= Gralinski LE, Menachery VD |titolo= Return of the Coronavirus: 2019-nCoV |rivista= Viruses |volume= 12 |numero= 2 |pp= 135 |data= January 2020 | pmid = 31991541 | doi = 10.3390/v12020135 }}</ref><ref>{{Cita pubblicazione|coautori= Lu R, Zhao X, Li J, Niu P, Yang B, Wu H, Wang W, Song H, Huang B, Zhu N, Bi Y, Ma X, Zhan F, Wang L, Hu T, Zhou H, Hu Z, Zhou W, Zhao L, Chen J, Meng Y, Wang J, Lin Y, Yuan J, Xie Z, Ma J, Liu WJ, Wang D, Xu W, Holmes EC, Gao GF, Wu G, Chen W, Shi W, Tan W |titolo= Genomic characterisation and epidemiology of 2019 novel coronavirus: implications for virus origins and receptor binding |rivista= [[The Lancet]] |volume= 395 |numero= 10224 |pp= 565–574 |data= February 2020 | pmid = 32007145 | doi = 10.1016/S0140-6736(20)30251-8 }}</ref> Gli studi hanno dimostrato che il SARS-CoV-2 ha un'affinità più elevata con ACE2 umano rispetto al SARS-CoV.<ref name="SCI-20200219">{{Cita pubblicazione|coautori= Wrapp D, Wang N, Corbett KS, Goldsmith JA, Hsieh CL, Abiona O, Graham BS, McLellan JS |titolo= Cryo-EM structure of the 2019-nCoV spike in the prefusion conformation |rivista= Science |volume= 367 |numero= 6483 |pp= 1260–1263 |data= February 2020 | pmid = 32075877 | doi = 10.1126/science.abb2507 | bibcode = 2020Sci...367.1260W }}</ref>
La proteina S può essere divisa in due subunità S1 e S2, la subunità S1 contiene il dominio di unione al recettore (DUR) ed è responsabile dell'attacoo iniziale del virus alla celula, tramite unione S1-recettore cellulare, mentre la subunità S2 è responsabile della fusione nella membrana cellulare per l'inserimento del RNA virale all'interno. Nei virus maturi la proteina S è presente come un trimero con tre DUR localizzate sulle tre subnità S1 che fanno da testa poggiando su uno stelo molto flessibile<ref name="science.sciencemag.org">{{Cita pubblicazione|nome=Beata|cognome=Turoňová|nome2=Mateusz|cognome2=Sikora|nome3=Christoph|cognome3=Schürmann|data=
=== Persistenza del virus ===
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==== Aria ====
Ricerche indicano che il virus può rimanere infettivo negli [[aerosol]] per ore mentre sulle superfici fino a giorni.<ref name="pmid32182409">{{Cita pubblicazione|coautori=van Doremalen N, Bushmaker T, Morris DH, Holbrook MG, Gamble A, Williamson BN, Tamin A, Harcourt JL, Thornburg NJ, Gerber SI, Lloyd-Smith JO, de Wit E, Munster VJ|data=March 2020|titolo=Aerosol and Surface Stability of SARS-CoV-2 as Compared with SARS-CoV-1|rivista=[[The New England Journal of Medicine]]|accesso=20 marzo 2020|doi=10.1056/NEJMc2004973|pmid=32182409}}</ref><ref>{{Cita pubblicazione|nome=John A.|cognome=Lednicky|nome2=Michael|cognome2=Lauzardo|nome3=Z. Hugh|cognome3=Fan|data=4 agosto 2020
==== Metalli e altri materiali ====
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Alle 24:00 del 1º febbraio 2020, la ''[[Commissione Nazionale di Sanità]]'' (istituzione cinese) indicava: {{formatnum:14411}} casi confermati di cui {{formatnum:2011}} considerati gravi, 304 decessi, 328 pazienti guariti e dimessi, {{formatnum:19544}} casi sospetti. {{formatnum:118478}} persone sono sotto osservazione medica.<ref>{{Cita web|url=http://www.nhc.gov.cn/xcs/yqtb/202001/1c259a68d81d40abb939a0781c1fe237.shtml|titolo=2019nCoV situation - China|accesso=29 gennaio 2020|urlarchivio=https://web.archive.org/web/20200129042016/http://www.nhc.gov.cn/xcs/yqtb/202001/1c259a68d81d40abb939a0781c1fe237.shtml|dataarchivio=29 gennaio 2020|urlmorto=sì}}</ref><ref>{{Cita web|url=http://en.nhc.gov.cn/2020-02/01/c_76084.htm|titolo=China National Health Center|urlmorto=sì}}</ref>
[[File:Citizens_of_Wuhan_lining_up_outside_of_a_drug_store_to_buy_masks_during_the_Wuhan_coronavirus_outbreak.jpg|thumb|left|Cittadini di [[Wuhan]] in coda per acquistare mascherine durante la [[pandemia di COVID-19 del 2019-2020]].]]
Sebbene non fossero ancora del tutto chiare le modalità di trasmissione del virus, era stato confermato che è in grado di passare da persona a persona. Un funzionario della sanità pubblica nello [[Washington (stato)|stato di Washington]] negli [[Stati Uniti]] ha osservato che i coronavirus vengono trasmessi principalmente "attraverso uno stretto contatto con un altro individuo, in particolare [[
Sebbene i virus respiratori siano trasmissibili solitamente quando il soggetto malato presenta anche i sintomi, sembrerebbe che il SARS-CoV-2 possa diffondersi anche in occasione di un contatto ravvicinato con un paziente asintomatico.<ref name=CDC-trasmission/> Si stima che il [[numero di riproduzione di base]] della trasmissione del virus da persona a persona sia tra il 1,4 e il 3,8. Tale valore indica il numero di altre persone a cui un paziente appena infetto possa trasmettere la malattia. Secondo quanto riferito, il nuovo coronavirus è stato finora in grado di trasmettersi in catena fino a un massimo di quattro persone.<ref>{{Cita web|url=https://www.sciencenews.org/article/how-new-wuhan-coronavirus-stacks-up-against-sars-mers|titolo=How the new coronavirus stacks up against SARS and MERS|cognome=Saey|nome=Tina Hesman|data=24 gennaio 2020|accesso=25 gennaio 2020|urlarchivio=https://web.archive.org/web/20200125064423/https://www.sciencenews.org/article/how-new-wuhan-coronavirus-stacks-up-against-sars-mers|dataarchivio=25 gennaio 2020}}</ref>
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I casi di infezione grave possono causare [[polmonite]], [[insufficienza renale acuta]], fino ad arrivare al [[morte|decesso]].<ref>{{Cita web|url=https://www.who.int/news-room/q-a-detail/q-a-coronaviruses|titolo=Q&A on coronaviruses|sito=www.who.int|lingua=en|accesso=27 gennaio 2020}}</ref> I pazienti presentano anche [[leucopenia]] (carenza di [[globuli bianchi]]) e [[linfocitopenia]] (carenza di [[linfociti]]).
Similmente all'[[influenza]] e al [[SARS-CoV]], il SARAS-CoV-2 infetta e distrugge gli [[Alveolo polmonare|alveoli]]. Al collasso della barriera cellulare separante gli alveoli dai vasi sanguigni, liquido dai vasi penetra gli alveoli bloccando il trasporto dell'ossigeno al sangue. Una reazione eccessiva del sistema immunitario può peggiorare il danno ai tessuti, fino ad arrivare ad danno è irreversibile che può risultare letale. Ma analogamente al [[SARS-CoV]] e [MERS-CoV] il danno non si ferma ai polmoni. Un'infezione da SARAS-CoV-2 può scatenare una risposta immunitari eccessive può causare una [[tempesta di citochine]] che può condurre a un'insufficienza multipla d’organo e alla morte.
In una dichiarazione rilasciata il 23 gennaio 2020, il direttore generale dell'[[Organizzazione mondiale della sanità]], Tedros Adhanom Ghebreyesus, ha dichiarato che un quarto degli infetti presentava ulteriori malattie gravi e che molti di quelli deceduti accusavano ulteriori patologie come [[ipertensione]], [[diabete]] o [[Cardiopatia|malattie cardiovascolari]] che alteravano il [[sistema immunitario]].<ref>{{Cita web|url=https://www.who.int/dg/speeches/detail/who-director-general-s-statement-on-the-advice-of-the-ihr-emergency-committee-on-novel-coronavirus|titolo=WHO Director-General's statement on the advice of the IHR Emergency Committee on Novel Coronavirus|sito=www.who.int}}</ref> Uno studio dimostra che la circonferenza del collo è un fattore di rischio per la necessità di ventilazione invasiva meccanica ed esito peggiore della malattia.<ref>{{Cita pubblicazione|nome=Stefano|cognome=Di Bella|nome2=Roberto|cognome2=Cesareo|nome3=Paolo|cognome3=De Cristofaro|data=14 giugno 2020|titolo=Neck circumference as reliable predictor of mechanical ventilation support in adult inpatients with COVID‐19: A multicentric prospective evaluation|rivista=Diabetes/Metabolism Research and Reviews|lingua=en|accesso=21 luglio 2020|doi=10.1002/dmrr.3354|url=https://onlinelibrary.wiley.com/doi/abs/10.1002/dmrr.3354}}</ref>
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