Monofilia: differenze tra le versioni

All'interno di questo grafico ogni singola lettera indica un gruppo monofiletico, ma potremmo definire come monofiletici anche l'insieme dei gruppi A e B, o C e D. Non è monofiletico, invece, l'insieme dei gruppi D e A, in quanto esclude altri gruppi che derivano dallo stesso antenato comune; in questo caso, di parla di gruppi [[parafilia|parafiletici]].

Nonostante sembri banale, l'individuazione di somiglianze strette tra cladi è estremamente complicata, a causa di diversi fenomeni molecolari che impediscono una caratterizzazione genetica di facile comprensione. Un esempio è la condizione della situazione tassonomica dei protisti in genere, per cui ancora non si è capito quali sono i gruppi appartenenti alla [[crown]], o ancora più specificatamente dei ciliati. Rapporti infatti dati per scontati per molti anni, come quello tra ''[[Euplotes]]'' ed ''[[Euplotidium]]'', o molti altri all'interno del gruppo degli [[ipotrico|ipotrichi]] sono stati sovvertiti più volte, anche a seconda del marcatore genetico che si va a studiare. Si guardi alla voce [[filogenesi]] per maggiori informazioni a proposito.