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Riga 3: Differenti basi azotate possono subire questo tipo di modificazione per diverse funzioni. L'[[adenina]] può essere metilata a livello delle sequenze G<sup>me</sup>ATC del genoma di alcuni batteri come ''[[Escherichia coli]]'' dall'enzima [[DNA-metiltransferasi sito-specifica (specifica per adenina)\|dam]] (DNA adenina metilasi). La funzione di questa metilazione è quella di proteggere il genoma della cellula dall'attacco delle [[endonucleasi]] di restrizione da lei stessa prodotte, come mezzo di resistenza all'attacco di [[fago\|fagi]]. Un altro esempio di metilazione del DNA è la metilazione della [[citosina]] nel dinucleotide CpG. Il dinucleotide CpG è poco rappresentato nel DNA degli eucarioti ~~poichè~~poiché soggetto a mutazione secondaria a metilazione. Questo tipo di metilazione è quasi assente in particolari zone del [[genoma]] eucariotico chiamate anche isole CpG <ref name=prodotti>[http://www.ricerca.it/RICERCA/Sezioni/SezMetilazione/index.asp Metilazione DNA epigenetica PraderWilli<!-- Titolo generato automaticamente -->]</ref>, contenenti parti regolative e promotori dei geni eucariotici; la metilazione di queste sequenze aumenta in particolari patologie come la [[sindrome di Prader-Willi]] <ref >[http://www.praderwilli.it/ Federazione Nazionale Sindrome di Prader Willi - Pagina Principale<!-- Titolo generato automaticamente -->]</ref>.La metilazione fisiologica del DNA in queste regioni che sono poste generalmente a monte di [[promotore\|promotori]] dipende da proteine chiamate Dnmt (es. 1, 3a 3b) ed è un fenomeno che interviene nel controllo dell'espressione genica, nell'inattivazione del cromosoma X, nella struttura cromatinica e nell'imprinting genomico, nella determinazione dell'imprinting biologico. La metilazione della [[citosina]] è anche un importante fattore di [[mutazione]] <ref name=prodotti/>. Infatti mentre la [[deaminazione]] della [[citosina]] produce [[uracile]] -una base azotata che non appartiene al DNA (bensì all'[[RNA]]) ed è immediatamente riconosciuta come estranea- la [[deaminazione]] della 5-metil citosina (<sup>5me</sup>C) la trasforma in [[timina]], generando un ''[[mismatch]]'', nel quale il sistema di riparazione dei mismatch (''[[mismatch repair]]'') non sempre preserva la corretta base azotata. Si sospetta che sia implicata anche nel taglio degli introni, e nella modifica degli esoni. ==Nei mammiferi== Line 17 ⟶ 16: ==Metilazione del DNA nel cancro== La metilazione del DNA è un importante regolatore della trascrizione genica ed è stato dimostrato che che la metilazione anormale del DNA è associata al silenziamento genico non programmato, ed i geni con alti livelli di 5-metilcitosina nella regione del promotore, sono trascrizionalmente silenziati. La metilazione del DNA è essenziale durante lo sviluppo embrionale, e nelle cellule somatiche, i pattern di metilazione del DNA sono generalmente trasmessi alle cellule figlie con un 'alta fedeltà. I pattern anormali di metilazione del DNA sono stati associati ad un gran numero di neoplasie umane e si trovano in due forme distinte: ipermetilazione e ipometilazione rispetto al tessuto normale. L’ipermetilazione è una delle principali modifiche epigenetiche che reprimono la trascrizione attraverso la regione promotrice di un gene oncosoppressore . L’ ipermetilazione si verifica in genere nelle isoleCpG nella regione del promotore ed è associata con l'inattivazione genica. L’ipometilazione globale è stata anche coinvolta nello sviluppo e nella progressione del cancro attraverso meccanismi diversi. ==DNA metiltransferasi== Line 26 ⟶ 24: DNMT1 è la metiltransferasi proposta per il mantenimento della metilazione ed è responsabile per la produzione di nuovi filamenti metilati, che si formano sulla basa dei filamenti stampo, già metilati in precedenza. Si pensa che DNMT3a e DNMT3b siano le metiltransferasi che determinano una metilazione de novo. DNMT3L è una proteina che è omologa alla DNMT3s altri, ma non ha attività catalitica. Invece, DNMT3L controlla le metiltransferasi de novo, aumentando la loro capacità di legarsi al DNA e stimolando la loro attività. Infine, DNMT2 (TRDMT1) è stato identificato come un omologo delle DNA metiltransferasi, e contiene tutti i 10 motivi di sequenza comuni a tutte le DNA metiltransferasi; tuttavia, DNMT2 (TRDMT1) non metila il DNA, ma metila citosina-38 nel loop dell’ anticodonedell’acido aspartico tRNA. Dal momento che molti geni oncosoppressori sono silenziati dalla metilazione del DNA durante la carcinogenesi, ci sono stati tentativi di ri-esprimere questi geni inibendo le DNMTs. La decitabina è un analogo nucleosidico che inibisce DNMTs intrappolandole in un complesso covalente sul DNA, impedendo la fase di β-eliminazione della catalisi, con conseguente degradazione degli enzimi .Tuttavia, ~~affinchè~~affinché la decitabina sia attiva, deve essere incorporata nel genoma della cellula, che può causare mutazioni nelle cellule figlie se la cellula non muore. Inoltre,la decitabina è tossica per il midollo osseo, e ciò limita la sua capacità terapeutica. Al momento non è ancora chiaro se DNMT1 da sola è sufficiente a riattivare geni oncosoppressori silenziati dalla metilazione del DNA. ==Nelle piante== Line 37 ⟶ 35: ==Bibliografia== * Elias Daura-Oller, Maria Cabre, Miguel A Montero, Jose L Paternain, and Antoni Romeu (2009)"Specific gene hypomethylation and cancer: New insights into coding region feature trends". Bioinformation. 2009; 3(8): 340–343.PMID PMC2720671 * Shen, L. & Waterland, R.A. (2008): ''Methods of DNA methylation analysis.'' In: ''Curr. Opin. Clin. Nutr. Metab. Care.'' 10(5):576–581. PMID 17693740 {{DOI\|10.1097/MCO.0b013e3282bf6f43}} * Beck, S. & Rakyan, V.K. (2008): ''The methylome: approaches for global DNA methylation profiling.'' In: ''Trends Genet.'' 24(5):231–237. PMID 18325624 {{DOI\|10.1016/j.tig.2008.01.006}} * Shames, D.S. et al.'' (2007): ''DNA methylation in health, disease, and cancer.'' In: ''Curr. Mol. Med.'' 7(1):85–102. PMID 17311535 [http://bentham.org/cmm/sample/cmm7-1/0008M.pdf PDF] [[~~categoria~~Categoria:~~biochimica~~Biochimica]] [[Categoria:DNA]]

Metilazione del DNA: differenze tra le versioni