Anna fu laera figlia di [[Francesco I de' Medici]], figlio e successore di Cosimo I, e di [[Giovanna d'Austria]], terza di una serie di sei figlie femmine partorite dalla granduchessa. Questa difficoltà a partorire un erede maschio fu un grave cruccio per Giovanna d'Austria, che si doveva relazionare con un marito ed una corte che la schernivano continuamente. Rivaleggiata dall'amante del marito, [[Bianca Cappello]], Giovanna finì per morire accidentalmentedi parto nella reggia di [[Palazzo Pitti]] pochiun annianno dopo aver dato alla luce un maschio, che pure morìsarebbe pocomorto tempoancora dopobambino di malattia.
Anna morì a soli quindici anni, nonsenza siche fecesi nemmenofacesse in tempo a iniziare per lei proposte matrimoniali.