La stazione venne attivata il 29 maggio [[1999]], come capolinea provvisorio del prolungamento proveniente da [[Ottaviano - San Pietro - Musei Vaticani (metropolitana di Roma)|Ottaviano]]<ref>''Metropolitana di Roma in crescita'', in "[[I Treni]]" n. 206 (luglio 1999), p. 8</ref>. Il 1º gennaio dell'[[2000|anno successivo]] la linea venne prolungata fino a [[Battistini (metropolitana di Roma)|Battistini]], e da tale data la stazione di Valle Aurelia costituisce una stazione di transito<ref>''Metropolitana di Roma'', in "[[I Treni]]" n. 212 (febbraio 2000), p. 8</ref>.