Il [[cladogramma]] seguente segue la topologia di un'analisi sui caratteri [[Morfologiamorfologia (biologia)|morfologici]] di Christopher A. Brochu e Glenn W. Storrs (2012). Molte specie estinte di ''Crocodylus'' potrebbero rappresentare diversi generi. ''C. suchus'' non è stato incluso, poiché i suoi codici morfologici erano identici a quelli di ''C. niloticus''. Tuttavia, gli autori hanno suggerito che potrebbe essere spiegato dal loro campionamento dei campioni e hanno considerato le due specie distinte.<ref name=C.thorbjarnarsoni>{{Cita pubblicazione|cognome1= Brochu |nome1= C. A. |cognome2= Storrs |nome2= G. W. | doi = 10.1080/02724634.2012.652324 |titolo= A giant crocodile from the Plio-Pleistocene of Kenya, the phylogenetic relationships of Neogene African crocodylines, and the antiquity of ''Crocodylus'' in Africa |rivista= Journal of Vertebrate Paleontology |volume= 32 |numero= 3 |pp= 587 |anno= 2012 }}</ref>