Motivo adiacente al Protospacer: differenze tra le versioni

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{{W|biologia|ottobre 2017}}
<span>Il '''Motivo adiacente al Protospacer ('''</span> ('''Protospacer adjacent motif''', in sigla '''PAM''') è una sequenza di 2-6 [[Coppia di basi|paia di basi]] immediatamente successiva alla sequenza di DNA identificata dalla nucleasi [[Cas9]] nel sistema immunitario adattativo dei batteri mediato dal sistema [[CRISPR]].<ref name="pmid23403393">{{Cita pubblicazione|coautori=Shah SA, Erdmann S, Mojica FJ, Garrett RA|titolo=Protospacer recognition motifs: mixed identities and functional diversity|rivista=[[RNA Biology]]|volume=10|numero=5|anno=2013|pp=891–899|doi=10.4161/rna.23764|pmc=3737346|pmid=23403393}}</ref>
 
PAM è il componente genico del plasmide o virus invadente, ma non è un componente del locus [[CRISPR]] del batterio. Se non seguita da nessuna sequenza PAM infatti, la sequenza di DNA da clivare/modificare non sarà né legata né riconosciuta da Cas9.<ref name="pmid19246744">{{Cita pubblicazione|coautori=Mojica FJ, Díez-Villaseñor C, García-Martínez J, Almendros C|titolo=Short motif sequences determine the targets of the prokaryotic CRISPR defence system|rivista=[[Microbiology (journal)|Microbiology]]|volume=155|numero=Pt&nbsp;3|anno=2009|pp=733–740|doi=10.1099/mic.0.023960-0|url=http://mic.sgmjournals.org/content/155/3/733.long|cid=|pmid=19246744}}</ref><ref name="pmid24578530">{{Cita pubblicazione|coautori=Shah SA, Erdmann S, Mojica FJ, Garrett RA|titolo=Protospacer recognition motifs: mixed identities and functional diversity|rivista=[[RNA Biology]]|volume=10|numero=5|anno=2013|pp=891–899|doi=10.4161/rna.23764|url=https://www.landesbioscience.com/journals/rnabiology/article/23764/|pmc=3737346|cid=|pmid=23403393|urlmorto=sì|urlarchivio=https://web.archive.org/web/20140904034408/https://www.landesbioscience.com/journals/rnabiology/article/23764/|dataarchivio=4 settembre 2014}}</ref><ref name="pmid22745249">{{Cita pubblicazione|coautori=Jinek M, Chylinski K, Fonfara I, Hauer M, Doudna JA, Charpentier E|titolo=A programmable dual-RNA-guided DNA endonuclease in adaptive bacterial immunity|rivista=[[Science (journal)|Science]]|volume=337|numero=6096|anno=2012|pp=816–821|doi=10.1126/science.1225829|url=https://www.sciencemag.org/content/337/6096/816.long|pmid=22745249}}</ref><ref name="pmid24476820">{{Cita pubblicazione|coautori=Sternberg SH, Redding S, Jinek M, Greene EC, Doudna JA|titolo=DNA interrogation by the CRISPR RNA-guided endonuclease Cas9|rivista=[[Nature (journal)|Nature]]|volume=507|numero=7490|anno=2014|pp=62–67|doi=10.1038/nature13011|pmc=4106473|pmid=24476820}}</ref>
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== Sequenze PAM ==
La PAM canonica è la sequenza 5'-NGG-3' dove "N" è qualsiasi nucleobase seguita da due nucleobasi contenenti [[Guanina|guanina]]<nowiki/>("G").<ref name="pmid25079318">{{Cita pubblicazione|volume=513|doi=10.1038/nature13579|PMID=25079318}}</ref>
 
Gli RNA-Guida (gRNAs) possono trasportare ovunque Cas9 per editare il genoma, a patto che la sequenza da clivare sia vicina ad una PAM.