Le Qualificazioni alla AFC Challenge Cup 2012 sono servite per determinare le 8 squadre che si sono qualificate alla fase finale del torneo che è stato giocato in Nepal.[1] I sorteggi sono stati effettuati il 20 ottobre 2010, nella sede dell'AFC a Kuala Lumpur, Malaysia.[2]
Le fasce sono stabilite in base al piazzamento nella AFC Challenge Cup 2010. Diversamente dalle edizioni passate, ad eccezione dell'edizione inaugurale, a nessun team è stata data la possibilità di accedere direttamente alla fase finale della competizione. I precedenti campioni della Corea del Nord, i secondi classificati del Turkmenistan e i terzi del Tagikistan dovranno comunque qualificarsi alla fase seguente. Le 8 squadre con il rank più basso prenderanno parte ai play-off, le restanti 12 squadre sono automaticamente qualificate alla fase a gironi.
Per la fase di pre-qualifica, le 8 squadre con il rank più basso giocheranno due partite andata e ritorno[3] con la regola del gol fuori casa, tempi supplementari e calci di rigore per determinare il vincitore qualora fosse necessario. Gli incontri sarebbero dovuti essere giocati il 9 e il 16 febbraio 2011 con i quattro vincitori qualificati per la fase a gironi, però a causa di problemi organizzativi per le partite tra Afghanistan e Bhutan, le rispettive partite sono state posticipate al 23 e al 25 marzo e sono state giocate al Tau Devi Lal Stadium a Panchkula in India.[4]
La partita di ritorno Filippine–Mongolia era originariamente programmata per il febbraio 2011, però a gennaio 2011 il presidente della Federazione Calcistica delle Filippine, Mariano Araneta, chiese che il match avrebbe dovuto esser giocato nella stessa sede della partita di andata il 12 febbraio a causa delle rigire condizioni dell'inverno in Mongolia.[5] Il presidente della Federazione calcistica della Mongolia, Ganbold Buyannemekh, insistette sul far giocare il ritorno in Mongolia e propose la data del 15 marzo.[6]
Nella fase a gironi, le 16 squadre sono state divise in quattro gruppi da 4 squadre ciascuna e i gironi saranno giocati con il girone all'italiana.[3] Nei gironi vengono incluse le 12 squadre automaticamente qualificate per ranking e le 4 squadre qualificate dai play-off. Le partite originariamente si sarebbero dovute tenere dal 20 al 31 marzo 2011.[2] La prima e la seconda classificata di ogni girone accederanno alla fase finale del torneo. Il 18 febbraio 2011, l'AFC annunciò le nazioni ospitanti dei rispettivi gironi: Birmania per il Gruppo A, Malaysia per il Gruppo B, Maldive per il Gruppo C, e Nepal per il Gruppo D; con le partite giocate il 21, 23 e 25 marzo 2011.[7]
Le partite del Gruppo D erano programmate per dal 21 al 25 marzo, ma il 7 febbraio 2011 la Federazione calcistica del Nepal annunciò di dover posticipare le qualificazioni dato che lo stadio principale, ll Dasarath Rangasala Stadium, sarebbe stato inagibile per un evento di wrestling. Le partite furono posticipade dal 7 all'11 aprile 2011.[8][9]
In caso di parità nella fase a gironi, verranno tenute conto le seguenti statistiche nel seguente ordine:[3]
Maggior numero di punti ottenuti contro la diretta avversaria;
^ab2012 AFC Challenge Cup draw results, in The-AFC.com, Asian Football Confederation. URL consultato il 20 ottobre 2010 (archiviato dall'url originale il 2 maggio 2020).
^ Henson, Joaquin, PFF readying Panaad for Challenge Cup, in PhilStar.com, The Philippine Star, 4 gennaio 2011. URL consultato il 16 febbraio 2011 (archiviato dall'url originale l'11 settembre 2012).
^ Galunan Jr., Jerome S., Mongolian XI insists on home and away, in Sun.Star, Bacolod, 8 gennaio 2011. URL consultato il 16 febbraio 2011 (archiviato dall'url originale il 2 aprile 2012).
Cambogia
Macao
Filippine
Mongolia
Taipei cinese
Laos
Bhutan
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Afghanistan
Palestina
Bangladesh
Birmania
India
Turkmenistan
Pakistan
India e 
Turkmenistan qualificate alla fase finale
Maldive
Tagikistan
Kirghizistan
Maldive e 
Tagikistan qualificate alla fase finale
Corea del Nord
Nepal
Sri Lanka
Corea del Nord e 
Nepal qualificate alla fase finale
Ruslan Sydykov (giocando contro il Tajikistan)